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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004539`

染色体: Chr03 坐标: 63409808-63413211 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004539`
名称	SmilChr03G004539
描述	protein SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOG 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63409808 - 63413211 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015436`
GeneID	`131015436`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015436`
原始查询	`SmilChr03G004539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOG 1-like
产物	protein SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOG 1-like
Arabidopsis	`AT1G15215` (SHH1) SAWADEE HOMEODOMAIN protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838088] identity=40.6; qcov=1; evalue=1.92e-59; confidence=medium
Rice	`Os09g0346900` - identity=42.6; qcov=1.08; evalue=1.5e-69; confidence=medium
GO	GO:0003682 (chromatin binding)
KEGG	-
Pfam	PF16719 (SAWADEE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015436

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799822.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057799822.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799822.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799822.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63410069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:63410076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:63410884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C76
`Chr3:63411736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B139,B90,B92,C77
`Chr3:63411837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799822.1

253 aa

126

253

SAWADEE

PF16719 SAWADEE 117-243 aa

XP_057799824.1

251 aa

126

251

SAWADEE

PF16719 SAWADEE 115-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799822.1`	Pfam	`PF16719`	SAWADEE	Domain	117	243	5.1e-46	156.5	SAWADEE domain
`XP_057799824.1`	Pfam	`PF16719`	SAWADEE	Domain	115	241	5e-46	156.6	SAWADEE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943839.1
AATTTTATAGTTTTATGAAGAGAGCGGCTAATCTTGATGACTCTCTCTCCTGTCTCACACTCTCTCTCTAAAACAAGCTGTCAGTGTTGAGGTTTTAAGCGGCAAATGGACCTCAGGCCGAGGCTTCGACAATCCTTCTCCGGCTTCACGAAATTCGAGGTTCAAAAAATGGAGCGATTACTTGACGATTATAAAGAGCAAACTCTAGAAGACGAGTTCTGTAAGAAATTTGCAAGACTTCTCAATCGTACGAGCGGTCG...

XM_057943841.1
TTTTATAGTTTTATGAAGAGAGCGGCTAATCTTGATGACTCTCTCTCCTGTCTCACACTCTCTCTCTAAAACAAGCTGTCAGTGTTGAGGTTTTAAGCGGCAAATGGACCTCAGGCCGAGGCTTCGACAATCCTTCTCCGGCTTCACGAAATTCGAGGTTCAAAAAATGGAGCGATTACTTGACGATTATAAAGAGCAAACTCTAGAAGACGAGTTCTGTAAGAAATTTGCAAGACTTCTCAATCGTACGAGCGGTCGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015436
ATGGACCTCAGGCCGAGGCTTCGACAATCCTTCTCCGGCTTCACGAAATTCGAGGTTCAAAAAATGGAGCGATTACTTGACGATTATAAAGAGCAAACTCTAGAAGACGAGTTCTGTAAGAAATTTGCAAGACTTCTCAATCGTACGAGCGGTCGTGCTGGAAAACCAGCTGTAAAGTGGACTGAGAGCTGGTTCCAGGAAAATCAACAGCGGGGCCTCTGTAGAGAGGCTTCGTTTGGTGAAGCTAAGAAGTTACCTGT...

LOC131015436
ATGGACCTCAGGCCGAGGCTTCGACAATCCTTCTCCGGCTTCACGAAATTCGAGGTTCAAAAAATGGAGCGATTACTTGACGATTATAAAGAGCAAACTCTAGAAGACGAGTTCTGTAAGAAATTTGCAAGACTTCTCAATCGTACGAGCGGTCGTGCTGGAAAACCAGCTGTAAAGTGGACTGAGGTTCAGAGCTGGTTCCAGGAAAATCAACAGCGGGGCCTCTGTAGAGAGGCTTCGTTTGGTGAAGCTAAGAAGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799822.1
MDLRPRLRQSFSGFTKFEVQKMERLLDDYKEQTLEDEFCKKFARLLNRTSGRAGKPAVKWTEVQSWFQENQQRGLCREASFGEAKKLPVAPETLTQNKATENAKMPEGVEDADFSMLEFEARSSKDGAWYDVDTFLSHRFLSSGEAELLLRYVGFGADEDEWVNARDSVRVRSVALEHTECQTVKVGDLVVCFQERQDQARYYDAHVLEIQRRWHDIRGCRCLFLIRYEHDNAEERVRLRRLCRRPTIMAKLK

XP_057799824.1
MDLRPRLRQSFSGFTKFEVQKMERLLDDYKEQTLEDEFCKKFARLLNRTSGRAGKPAVKWTESWFQENQQRGLCREASFGEAKKLPVAPETLTQNKATENAKMPEGVEDADFSMLEFEARSSKDGAWYDVDTFLSHRFLSSGEAELLLRYVGFGADEDEWVNARDSVRVRSVALEHTECQTVKVGDLVVCFQERQDQARYYDAHVLEIQRRWHDIRGCRCLFLIRYEHDNAEERVRLRRLCRRPTIMAKLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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