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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004540`

染色体: Chr03 坐标: 63416965-63422451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004540`
名称	SmilChr03G004540
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63416965 - 63422451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015467`
GeneID	`131015467`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015467`
原始查询	`SmilChr03G004540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 4-like
产物	histidine-containing phosphotransfer protein 4-like
Arabidopsis	`AT3G16360` (AHP4) HPT phosphotransmitter 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820883] identity=60; qcov=0.957; evalue=1.18e-60; confidence=high
Rice	`Os01g0743800` (OsPHP1) - identity=57.9; qcov=0.993; evalue=6.47e-57; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01627 (Hpt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015467

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799872.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799872.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799872.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799872.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63421053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:63421778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799872.1

141 aa

141

Hpt

PF01627 Hpt 44-127 aa

XP_057799873.1

141 aa

141

Hpt

PF01627 Hpt 44-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799872.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	44	127	1.6e-11	45.0	Hpt domain
`XP_057799873.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	44	127	1.6e-11	45.0	Hpt domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943890.1
ATATAACATGGAATATGAAAGAAATTAGTTTGGGTATAAAGCTATACATGCATACAGCACACTGGCAAACTAAATCCTATTTTGCTGCATCTGAAATCGTAGAACACGCGATACAATATCACGAAAGTTTCATGCTGGATATGCTAATTACAATGTCCATTTCCCTAAGAAAGCAGCAACAAATCGAAGCTCTCGATTTCATTCATCAACAACAGCCGATCTATCGATCCGTAACACCAGCCGATTTCTCTTCACCAAAG...

XM_057943889.1
AAAGAAATTAGTTTGGGTATAAAGCTATACATGCATACAGCACACTGGCAAACTAAATCCTATTTTGCTGCATCTGAAATCGTAGAACACGCGATACAATATCACGAAAGTTTCATGCTGGATATGCTAATTACAATGTCCATTTCCCTAAGAAAGCAGCAACAAATCGAAGCTCTCGATTTCATTCATCAACAACAGCCGATCTATCGATCCGTAACACCAGCCGATTTCTCTTCACCAAAGTTAAATCACCGGTTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015467
ATGGAGAGTAATCAACTGCAATGCCAAGCTTCCTACATGAGAAACGCTCTATTCAGTCAGGGATACCTTGATGAACAGTTCCTTCAATTGGAAGATTTGCAAGATGAAGCTAACCCCAACTTTGTGGAAGAAGTGGTCAAGCTATTTTACACGGACTCGGCCCGCCTTATTCGAAACATAGAACTGACACTAGAAAATACTCCATGGGACTTCGAGAAACTGGATAATATTATGCATCAGTACAAGGGTAGCAGCTCTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799872.1
MESNQLQCQASYMRNALFSQGYLDEQFLQLEDLQDEANPNFVEEVVKLFYTDSARLIRNIELTLENTPWDFEKLDNIMHQYKGSSSSIGAKKVKKECTQFQEYCKVENIDGCVRTFQEVKQQHAALKRKLENYFQLVREAR

XP_057799873.1
MESNQLQCQASYMRNALFSQGYLDEQFLQLEDLQDEANPNFVEEVVKLFYTDSARLIRNIELTLENTPWDFEKLDNIMHQYKGSSSSIGAKKVKKECTQFQEYCKVENIDGCVRTFQEVKQQHAALKRKLENYFQLVREAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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