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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004548`

染色体: Chr03 坐标: 63454705-63457350 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004548`
名称	SmilChr03G004548
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17-2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63454705 - 63457350 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015446`
GeneID	`131015446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015446`
原始查询	`SmilChr03G004548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17-2-like
产物	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17-2-like
Arabidopsis	`AT2G37410` (TIM17-2) translocase inner membrane subunit 17-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818317] identity=84.5; qcov=0.688; evalue=2.52e-89; confidence=high
Rice	`Os07g0604500` - identity=81.7; qcov=0.712; evalue=1.25e-86; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0005744 (TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex); GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF02466 (Tim17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799838.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057799838.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057799838.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799838.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63455596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B56,B96
`Chr3:63455668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:63455890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:63455896`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr3:63455896`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr3:63456062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:63456106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:63456117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:63456153`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	100	A1,A15,A2,A21,A6,B1,B100,B101,B105,B106,B109,B11,B112,B113,B114,B115,B122,B126,B127,B128,B130,B135,B14,B16,B17,B21,B27,B29,B3,B30,B32,B33,B38,B39,B41,B44,B46,B49,B5,B54,B56,B59,B6,B62,B64,B71,B74,B77,B79,B81,B83,B87,B89,B9,B93,B97,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C20,C28,C32,C34,C38,C41,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C56,C59,C61,C62,C64,C66,C68,C73,C74,C75,C76,C78,C84,C86,C87,C9,D10,D11,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr3:63456154`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A24
`Chr3:63456154`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A24
`Chr3:63456176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799838.1

215 aa

108

215

Tim17

PF02466 Tim17 15-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799838.1`	Pfam	`PF02466`	Tim17	Family	15	122	1e-31	110.2	Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098501.1
CGAAATTAGAATATTAGGGCCAACTTTCCAAAATTAAAATTACCCTTAGTAGAGTTTCTTCTCTCTTTCAACGATTCTCTTACACACGTCCACCGGCTTTCCCCTCTTTCTAGTGTCGTCCACAAAAACCCACGAAACGACGCATTCTGAGGGGAGGCGACAGAAATCATCTGAAATACCGGGAACAAGTGATAAAGAAAAATTTATTTGTGTACCTTTTATTTCATTGGTTCACCGGCTTTGATCCATGGGCACCCCGG...

XR_009098503.1
TAGAATATTAGGGCCAACTTTCCAAAATTAAAATTACCCTTAGTAGAGTTTCTTCTCTCTTTCAACGATTCTCTTACACACGTCCACCGGCTTTCCCCTCTTTCTAGTGTCGTCCACAAAAACCCACGAAACGACGCATTCTGAGGGGAGGCGACAGAAATCATCTGAAATACCGGGAACAAGTGATAAAGAAAAATTTATTTGTGTACCTTTTATTTCATTGGTTCACCGGCTTTGATCCATGGGCACCCCGGAAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015446
ATGGGCACCCCGGAAACAACTAGAGAGCCTTGCCCGGATCGTATCCTTGATGACGTAGGTGGTGCTTTTGGGATGGGGGCTGTTGGTGGTGCAGCCTTCCATTTCTTGAAGGGAATCTATAACTCCCCGAAAGGCGAGCGTTTGGCTGGGGGTTCTCAAGCAGTTCGCATGAATGCTCCTCGTGTTGGTGGCAGTTTTGCAGTATGGGGTGGGCTCTTTTCCACCTTCGACTGTACAATGGTGTACATGCGGCAAAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799838.1
MGTPETTREPCPDRILDDVGGAFGMGAVGGAAFHFLKGIYNSPKGERLAGGSQAVRMNAPRVGGSFAVWGGLFSTFDCTMVYMRQKEDPWNSIIAGAATGGFLQMRQGMGAASRSALFGGVLLALIEGAGIMINKVVSAPQNLPPMEDPLPNVAGMPGYPGQMPGYPGQMPGQPPISIDSMGAGSSSSSPSPSSSPSSSSWFGGPFWREGGDSTQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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