当前解析结果
SmilChr03G004561| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004561 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004561 |
| 描述 | early nodulin-93-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 63558012 - 63560227 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015476 |
|---|---|
| GeneID | 131015476 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015476 |
| 原始查询 | SmilChr03G004561 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | early nodulin-93-like |
| 产物 | early nodulin-93-like |
| Arabidopsis | AT5G25940 (AT5G25940)early nodulin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832663] identity=64.1; qcov=0.936; evalue=5.06e-26; confidence=medium |
| Rice | Os02g0227200 (OsENOD93b)- identity=55.7; qcov=0.8; evalue=3.06e-24; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03386 (ENOD93) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015476 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057799883.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057799883.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057799883.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799883.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799883.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:63558319 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr3:63558769 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A2 |
Chr3:63558769 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr3:63558772 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057799883.1PF03386
ENOD93 25-107 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057799883.1 |
Pfam | PF03386 |
ENOD93 | Domain | 25 | 107 | 1.4e-41 | 141.0 | Early nodulin 93 ENOD93 protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。