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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004582`

染色体: Chr03 坐标: 63681003-63685598 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004582`
名称	SmilChr03G004582
描述	uncharacterized SmilChr03G004582
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63681003 - 63685598 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015349`
GeneID	`131015349`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015349`
原始查询	`SmilChr03G004582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137]; symbol=AT2G25970; hit=AT2G25970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137]; symbol=AT2G25970; hit=AT2G25970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25970` (AT2G25970) KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817137] identity=55.4; qcov=0.981; evalue=6.06e-143; confidence=high
Rice	`Os08g0110800` - identity=55.8; qcov=0.275; evalue=2.18e-57; confidence=weak
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015349

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799706.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057799706.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799706.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799706.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63681131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:63681149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B80,C18,C9
`Chr3:63681159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:63681170`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A13,A14,A9,B21,B29,B41,B44,B62,B65,B75,C19,C6,C64,C66,C9
`Chr3:63681264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr3:63681296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:63681346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:63681356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:63681373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B38,B39,C38
`Chr3:63681461`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A13,A14,A9,B18,B21,B3,B5,B6,B62,B65,B75,B83,B86,B93,C19,C6,C64,C66,C9,D5
`Chr3:63681476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:63681498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B135,B138,B18,B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799706.1

633 aa

316

633

KH_1

PF00013 KH_1 123-189 aa PF00013 KH_1 217-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799706.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	123	189	7.1e-41	138.5	KH domain
`XP_057799706.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	217	283	7.1e-41	138.5	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943723.1
AATCTGGAGTGGGCCATGCCCATATAAATACCTCATCCTTAATTCTCTCTCATCTGCAAAATCTAGGGTTTTTCCATCTCCTCTTCCCGTGCGCAATTTCCTGTATTTTCCGGCAGAAATGGCAGATGAGGCGGTCTACGCTGCAGGAGGCGAATCGAACAAGCGCAAGTACGATGATTCGCCGCCAGCTGTGGGGCGCAGGTCGACGGGGTTCTCGTCGCCGCCCGATTCCGCCGCACCTCCGCCTTCGTACAACAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015349
ATGGCAGATGAGGCGGTCTACGCTGCAGGAGGCGAATCGAACAAGCGCAAGTACGATGATTCGCCGCCAGCTGTGGGGCGCAGGTCGACGGGGTTCTCGTCGCCGCCCGATTCCGCCGCACCTCCGCCTTCGTACAACAACGTTCCGCCGCCCTTGAACGAGATCGAGCTGGCTAAGCAGAAGGCGCAGGAGATTGCTGCGAGGCTTCTGAACAACGCTGATCCTTCGAAGAGAGCGAGAGTTGAGAACGGGGCTGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799706.1
MADEAVYAAGGESNKRKYDDSPPAVGRRSTGFSSPPDSAAPPPSYNNVPPPLNEIELAKQKAQEIAARLLNNADPSKRARVENGAGAGGGYDAVDTGVSHKHPGLGLGGPAQSASYGYPGPSKKIDIPNGRVGVIIGKGGETIKYLQLQSGAKIQVTRDMDADPNSTSRAVELMGTPDQIAKAEQLINDVLNEADAGGSGIVSRRLTGQQSGADQFVMMIPNNKVGLVIGKGGETIKSMQAQTGARIQVIPLHLPPGDMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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