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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004585`

染色体: Chr03 坐标: 63700151-63704020 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004585`
名称	SmilChr03G004585
描述	protein NDL2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63700151 - 63704020 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015409`
GeneID	`131015409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015409`
原始查询	`SmilChr03G004585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NDL2-like
产物	protein NDL2-like
Arabidopsis	`AT5G11790` (NDL2) N-MYC downregulated-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831051] identity=75.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0224800` - identity=72.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03096 (Ndr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799774.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799774.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799774.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799774.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63701545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:63702080`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr3:63702080`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr3:63702250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B136
`Chr3:63702270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:63702291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr3:63702438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C14
`Chr3:63702990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:63703252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63703264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B89
`Chr3:63703569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:63703663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B50,C37,C51,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799774.1

350 aa

175

350

Ndr

PF03096 Ndr 21-308 aa

XP_057799775.1

347 aa

174

347

Ndr

Abhydrolase_1

PF03096 Ndr 21-305 aa PF00561 Abhydrolase_1 74-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799774.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	21	308	9.6e-104	346.8	Ndr family
`XP_057799775.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	21	305	4.5e-106	354.4	Ndr family
`XP_057799775.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	74	161	2.9e-06	27.9	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943792.1
ACGTTGGACTCAACTCACCTTTACATACACCTATACATACATTCGCTCTCATTATATATATGTCATATATGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGGATTGGTATTTAAGCTGTGGATACCAAATCGAACGCGTCTGGAGCTGGAGAGAGGAAGATTAAATAATTAGAGAGAGAGAGAGAGAATTAGAAGGAAAGGAAGTGCAATGGCGGACTCCAGCGATTCCGTCTCCGTCGATATGGAGTCCATTCCGTT...

XM_057943791.1
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGGATTGGTATTTAAGCTGTGGATACCAAATCGAACGCGTCTGGAGCTGGAGAGAGGAAGATTAAATAATTAGAGAGAGAGAGAGAGAATTAGAAGGAAAGGAAGTGCAATGGCGGACTCCAGCGATTCCGTCTCCGTCGATATGGAGTCCATTCCGTTCGCCGGAAAGGAGCATATTATCAAGACGGGTCATGGTTCTGTCTCTGTTGCTGTATTTGGAGACCAGGACAAGCCAGCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015409
ATGGCGGACTCCAGCGATTCCGTCTCCGTCGATATGGAGTCCATTCCGTTCGCCGGAAAGGAGCATATTATCAAGACGGGTCATGGTTCTGTCTCTGTTGCTGTATTTGGAGACCAGGACAAGCCAGCTCTTATTACCTATCCTGATTTGGCTTTAAACTATATGTCCTGTTTCCAAGGATTGTTCTTTTGTCCAGAAGCATTTTCTCTCCTTCTCCATAACTTCTGTATCTACCACATCAGTCCTCCTGGTCATGAGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799774.1
MADSSDSVSVDMESIPFAGKEHIIKTGHGSVSVAVFGDQDKPALITYPDLALNYMSCFQGLFFCPEAFSLLLHNFCIYHISPPGHELLQLGAAVAGPDEPSLTVDELADQIAEILDYFGLGAVMCLGVTAGAYILTLFALKHSRRVMGLILVSPLCKSPSWTEWLCNKVMSNLLYICGMCGIVKELLLMRYFSKEVRGGVDVPESDIVQSCRRLLDERQSPNVLRFLEAINGRPDISNSLRKLQCRTLIFVGENSHFHYE...

XP_057799775.1
MADSSDSVSVDMESIPFAGKEHIIKTGHGSVSVAVFGDQDKPALITYPDLALNYMSCFQGLFFCPEAFSLLLHNFCIYHISPPGHELGAAVAGPDEPSLTVDELADQIAEILDYFGLGAVMCLGVTAGAYILTLFALKHSRRVMGLILVSPLCKSPSWTEWLCNKVMSNLLYICGMCGIVKELLLMRYFSKEVRGGVDVPESDIVQSCRRLLDERQSPNVLRFLEAINGRPDISNSLRKLQCRTLIFVGENSHFHYEALH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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