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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004586`

染色体: Chr03 坐标: 63704663-63708546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004586`
名称	SmilChr03G004586
描述	homeobox protein ATH1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63704663 - 63708546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015385`
GeneID	`131015385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015385`
原始查询	`SmilChr03G004586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox protein ATH1-like
产物	homeobox protein ATH1-like
Arabidopsis	`AT4G32980` (ATH1) homeobox protein ATH1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829435] identity=53.6; qcov=0.603; evalue=1.98e-95; confidence=high
Rice	`Os02g0226600` - identity=45.7; qcov=0.494; evalue=1.41e-63; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF05920 (Homeobox_KN); PF07526 (POX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799748.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799748.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799748.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799748.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63704938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B21,B90,B92
`Chr3:63705322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:63705332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:63705340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C23,C42,C62
`Chr3:63705490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B30,C62,C77
`Chr3:63705573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D11
`Chr3:63705762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C85
`Chr3:63705839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C85
`Chr3:63706043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C83
`Chr3:63706101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B133,D5
`Chr3:63706179`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr3:63706179`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799748.1

443 aa

222

443

POX

Homeobox_KN

Homeodomain

PF07526 POX 184-301 aa PF05920 Homeobox_KN 360-399 aa PF00046 Homeodomain 362-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799748.1`	Pfam	`PF07526`	POX	Domain	184	301	1.1e-24	88.2	Associated with HOX
`XP_057799748.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	360	399	3.5e-16	59.5	Homeobox KN domain
`XP_057799748.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	362	399	1.5e-05	25.5	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943765.1
ATATTGCTTGCATCATCATTGCATACACACACACACACATACTGTTCCTTTCTCTCACCTCTCTCTAAGCTGACTGAAAGTATAATACACACACTGGTGGTGCAACAGTATCATAGACATTTCCCTCTATTCACTTTGCCCTAACCCTTTATTTGTTCCATTCAGCTGCAAAAAGCCTCTTGTGTTTCTTTCCCCAATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCCTTTCTCCATCACCATTGCATCTCAATACACTACTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015385
ATGCAAAGAGACGCTGCAACGGGGCCATATTACCCCGTTGCAGACGGGGCCTCGTTGCACTCGGCCTTGATCTCCCTCGGTTACTCCGATCTAAGCCACGTCATGGCGGGGTTTCCCCTTCCCCCGGCCTTCGGGGAGGAGACGGTGGCGAGCAGCCGCGTCGGAGACGAGTTTTGGAGCACTCCTAGTGCTCCTTACACCTTTGAGCCCTCCAAAATTGGTGTGGACTCCATGTTTGAGGCCCCGGTCGAAGCCCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799748.1
MQRDAATGPYYPVADGASLHSALISLGYSDLSHVMAGFPLPPAFGEETVASSRVGDEFWSTPSAPYTFEPSKIGVDSMFEAPVEALPFDPTAGWVVPCPELQESSITMSEWSLNPHNPNPGPSRFSKELSLSLATSSHPRVAVRGGAPPEPELSSSGVSSHTSGSSLSLNFASCGAAFPAATLLPGSPFFEAMQEILAEFASYTLVNCDHTSLGSSDRSFVFHNNNNNNFSYGKEMEIESKKRHLMSLLQVVDDQYNQCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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