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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004593`

染色体: Chr03 坐标: 63756146-63757335 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004593`
名称	SmilChr03G004593
描述	pathogen-associated molecular patterns-induced protein A70-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63756146 - 63757335 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015435`
GeneID	`131015435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015435`
原始查询	`SmilChr03G004593`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogen-associated molecular patterns-induced protein A70-like
产物	pathogen-associated molecular patterns-induced protein A70-like
Arabidopsis	`AT5G56980` (AT5G56980) cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835800] identity=57.1; qcov=0.298; evalue=1.68e-14; confidence=weak
Rice	`Os05g0540900` - identity=40.6; qcov=0.372; evalue=3.67e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761); PF14364 (DUF4408)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799821.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799821.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799821.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799821.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799821.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63756283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C31
`Chr3:63756336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C28
`Chr3:63756427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:63756600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B42,B43
`Chr3:63756631`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr3:63756631`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr3:63756849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:63756894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B99
`Chr3:63756899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B81
`Chr3:63756922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C79
`Chr3:63756939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799821.1

258 aa

129

258

DUF4408

DUF761

PF14364 DUF4408 13-44 aa PF05553 DUF761 221-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799821.1`	Pfam	`PF14364`	DUF4408	Family	13	44	4.1e-13	49.6	Domain of unknown function (DUF4408)
`XP_057799821.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	221	255	1.9e-16	60.1	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943838.1
ACCACCTACTATAGTCTATACACCACCATTGCTTCATCCCCCAATCCATCTCCCCTCTTCCCACAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTAACCAGTCACCAAGTCCAGCCAAAATGCTGGAAGATTCAGCCTCTGCAATCCCATCTTCTTCTCTCTGGGCATCCATGAACAGCTGGTTAACCCCCACAGTCCTCTTCCTCCTCCTCAATCTCATGATCGCCACCATTGCCTTCACCTCCCATTTCTCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015435
ATGCTGGAAGATTCAGCCTCTGCAATCCCATCTTCTTCTCTCTGGGCATCCATGAACAGCTGGTTAACCCCCACAGTCCTCTTCCTCCTCCTCAATCTCATGATCGCCACCATTGCCTTCACCTCCCATTTCTCCAAAAAAAACCCCTCCCCCGCCGCCGCCGCCCTCGCCAGATCGCCCTCCCTCCTCCACCGCCTCAAATCCTTCAACAACCTCTACTCCTCCCCTCCGCCGCCCCCCTCCTCCCTCCACCACAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799821.1
MLEDSASAIPSSSLWASMNSWLTPTVLFLLLNLMIATIAFTSHFSKKNPSPAAAALARSPSLLHRLKSFNNLYSSPPPPPSSLHHKQIPDSDAHATHYFFPPQETPISAAQTAPEIPAHFDSHQKAPIFADFEEAHEAEMAAAEENLDKSMDEVYNQLADSHFSRTKSDTKPTGGEIPAKLAAKMRKSASVKSPFNHFEEGDIVEARRPATARPPPSAAADDGVDAKADDFINRFKQQLKLQRLDSIIRYKDMIGRGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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