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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004594`

染色体: Chr03 坐标: 63764055-63765487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004594`
名称	SmilChr03G004594
描述	NDR1/HIN1-like protein 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63764055 - 63765487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015433`
GeneID	`131015433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015433`
原始查询	`SmilChr03G004594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NDR1/HIN1-like protein 6
产物	NDR1/HIN1-like protein 6
Arabidopsis	`AT5G11890` (EMB3135) harpin-induced protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831062] identity=37.6; qcov=1.09; evalue=5.1e-44; confidence=medium
Rice	`Os01g0574800` - identity=29.3; qcov=0.846; evalue=5.3e-28; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799819.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799819.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799819.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799819.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799819.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63764440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B83,C43,C59
`Chr3:63764492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:63764497`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B60,B77,B90,B92,B98,C26,C71,C75,C9,D11
`Chr3:63764513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr3:63764541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:63764562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B138,B22,C13,C87
`Chr3:63764598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:63764601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:63764603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:63764605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B82,C27,C4,C86
`Chr3:63764619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C34
`Chr3:63764624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943836.1
AAATTGAATAAAATAAATGAAAAATTAAACAATATACAGATTTAGAGCCACAATTTGTTGAAGTGGCAACCATTACTTCTTGTTTTTCACTGTCTACTTTTTCCATCTTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCACTAGAAATTCTTCTTCTTTCTCTCTCTCACTAGAAAAACAATTTCTTTCTCCTCACTTCACTAGCTCACTTTCTTTAATCTTCAAACCATTTTATACTAATTTTCTTACATCAACTTCTCCACCTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015433
ATGACTGACAGAGTCTACCCATCAACCAAGCCAAACTCCGCCGCCGCCGCCAAGCCCACGGCGGCGGGGCCCCTGCCCGCTCCACCGGCGAAATACAACCCGAACCGGCACCCCTACCGCCCGAATCCGACCTCGCGCCACCGCCAGAAGAAAACCCCCAAATTCAGCTGCCGCCGCTGCTGCTGCCTCACCTGCTTCTGGTCGGTCCTCCTCCTAACCCTAACCCTCCTCATCGCCGCCATCGCCGCCGCCGCCTTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799819.1
MTDRVYPSTKPNSAAAAKPTAAGPLPAPPAKYNPNRHPYRPNPTSRHRQKKTPKFSCRRCCCLTCFWSVLLLTLTLLIAAIAAAAFYALYHPHRPAFSVTSVKISAFNLTTTPADDSTRLTARINVTLSAKNPNKKIQFAYDAMSIALLSRSVILSNTSYAAFNSSAGAISVIHAATPPRTQLLDADSLNLLKSDLRRPRGLPIRIVVDTAVAVKIDKLKARKFGIRVKCDGIHGAVPRGKTVIPANTAAADCQVDLRIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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