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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004599`

染色体: Chr03 坐标: 63786949-63788739 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004599`
名称	SmilChr03G004599
描述	acyl-lipid (9-3)-desaturase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63786949 - 63788739 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015384`
GeneID	`131015384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015384`
原始查询	`SmilChr03G004599`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acyl-lipid (9-3)-desaturase-like
产物	acyl-lipid (9-3)-desaturase-like
Arabidopsis	`AT2G46210` (SLD2) Fatty acid/sphingolipid desaturase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819228] identity=61.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0338500` - identity=60.4; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016717 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with oxidation of a pair of donors resulting in the reduction of molecular oxygen to two molecules of water)
KEGG	-
Pfam	PF00173 (Cyt-b5); PF00487 (FA_desaturase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799747.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057799747.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799747.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799747.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63787314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:63787351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:63787406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B17
`Chr3:63787406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:63787494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:63787619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C38
`Chr3:63787828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C74
`Chr3:63788033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:63788130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B35,B55
`Chr3:63788238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63788325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B35,B55,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799747.1

448 aa

224

448

Cyt-b5

FA_desaturase

PF00173 Cyt-b5 9-77 aa PF00487 FA_desaturase 140-406 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799747.1`	Pfam	`PF00173`	Cyt-b5	Domain	9	77	2.1e-21	76.4	Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain
`XP_057799747.1`	Pfam	`PF00487`	FA_desaturase	Domain	140	406	2.5e-36	126.4	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943764.1
AGCAAGATTCCAGCTCTTCTTCCTCTCACACAATATATATCTCTCCCCAAAATCCCCCCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCAACCAATGGCGTAGAAGAGATTGAGAGAAGAAGAAGAGAGATAAAGCTAAAAGCTCCCTCACACCACACCAGAGCTCACCTCTCTCTCCCTCTCTCTAAAACCCTCCTCCCAAAATCGAATCTTGCGCCGCCCCAGCAATGGCGGAGAGCCAGAAATACATCACCGCCGACGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015384
ATGGCGGAGAGCCAGAAATACATCACCGCCGACGAGCTGGCCACCCACACCACCTCCGGCGACCTCTGGATCTCCATCCACGGCAAAATCTACGACGTCTCGCGCTGGATCAAATCCCACCCCGGCGGCGACCTCCCCCTCCGCAACCTCGCCGGCCGCGACGCCACCGACGCATTCCTCGCCTACCACCCCACCCGCGCCTGGCCCCACCTCGCCCAATTCCACAACGGCCTCCACCTCCAAAACTACGCCGTTTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799747.1
MAESQKYITADELATHTTSGDLWISIHGKIYDVSRWIKSHPGGDLPLRNLAGRDATDAFLAYHPTRAWPHLAQFHNGLHLQNYAVSEVSKDYRKLLHDFTKIGLFENKGHNVFLSLTAIALLFSLSLYGVVFVQNSPFLHALCGAAMGFLWIQSGWLGHDSGHYQIMLTRNQNRFIQILSGNCLAGISIAWWKRNHNAHHIAVNSLDHDPDLQHMPFFAVSTKLFGSITSLYYNRKMEFDKFARFLISKQHWTYYPVMSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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