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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004607`

染色体: Chr03 坐标: 63822711-63823502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004607`
名称	SmilChr03G004607
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63822711 - 63823502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019172`
GeneID	`131019172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019172`
原始查询	`SmilChr03G004607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT3G21210` (AT3G21210) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674] identity=31; qcov=0.711; evalue=8.84e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=29.8; qcov=0.715; evalue=8.39e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803840.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057803840.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057803840.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803840.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63822738`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B126,C27,C86
`Chr3:63822741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:63822774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B121,B134,C28,C29
`Chr3:63822807`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B129,B130,B32,B41,B60,C17,C19,C2
`Chr3:63822810`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B129,B130,B32,B41,B60,C17,C19,C2
`Chr3:63822843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:63822891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C78
`Chr3:63822896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr3:63822934`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A18,A8,A9,B103,B106,B11,B117,B12,B125,B128,B129,B2,B3,B32,B39,B41,B45,B5,B53,B71,B75,B90,C17,C19,C21,C25,C36,C50,C52,C56,C63,C83,C85,C87,D10
`Chr3:63822942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B44,B60,B96,C29
`Chr3:63822948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B93
`Chr3:63822969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803840.1

263 aa

132

263

C1_2

PF03107 C1_2 17-64 aa PF03107 C1_2 75-120 aa PF03107 C1_2 134-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803840.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	17	64	1.4e-26	93.2	C1 domain
`XP_057803840.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	75	120	1.4e-26	93.2	C1 domain
`XP_057803840.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	134	182	1.4e-26	93.2	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947857.1
ATGGCGTGCTTCCACTTGCCATCTCGCCTTCCCTCAATTCCACTCCACCACCAATCTGGTCACCACCTGATTCTCAAATCTTGTGACGAACTTCCATCCAAGGAGTGGGAGTGCAAGGTGTGCTCTCTCGACTCAAGTGGGCTGTTCTACGCTTGTACGGAATGCAACTTCATAGCAGACATCAAGTGCGCTTCTCTGCCGGCCACCATATATCACACGGCTCACCCACAACATCCCCTCCACTTTCAATCTGGCGGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019172
ATGGCGTGCTTCCACTTGCCATCTCGCCTTCCCTCAATTCCACTCCACCACCAATCTGGTCACCACCTGATTCTCAAATCTTGTGACGAACTTCCATCCAAGGAGTGGGAGTGCAAGGTGTGCTCTCTCGACTCAAGTGGGCTGTTCTACGCTTGTACGGAATGCAACTTCATAGCAGACATCAAGTGCGCTTCTCTGCCGGCCACCATATATCACACGGCTCACCCACAACATCCCCTCCACTTTCAATCTGGCGGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803840.1
MACFHLPSRLPSIPLHHQSGHHLILKSCDELPSKEWECKVCSLDSSGLFYACTECNFIADIKCASLPATIYHTAHPQHPLHFQSGGGVVTYCDAMCGEITYIYGCYACGSCEFIVHVRCAVLAASITSRRWDKHHPLLLTYDANLNHQGESIYCDACETAETNPKRWMYRCRHCDLSIHPRCLKSTSGAYRNIKFGDKYVINDAALHPPHPLAYQLLPKRRCDLCHRDRYEWRGFQCASCNFCVCLYDCGEKMLNNGKMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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