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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004618`

染色体: Chr03 坐标: 63880094-63880841 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004618`
名称	SmilChr03G004618
描述	glutaredoxin-C10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63880094 - 63880841 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015470`
GeneID	`131015470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015470`
原始查询	`SmilChr03G004618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutaredoxin-C10
产物	glutaredoxin-C10
Arabidopsis	`AT4G33040` (AT4G33040) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829441] identity=58.5; qcov=1.01; evalue=2.01e-44; confidence=medium
Rice	`Os05g0198200` (OsGRX16) - identity=58.6; qcov=0.744; evalue=1.16e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799876.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799876.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799876.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799876.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63880430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63880470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:63880483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:63880502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:63880506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63880512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63880524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:63880532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:63880556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C66,D11,D5
`Chr3:63880569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C66,D11,D5
`Chr3:63880575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C66,D11,D5
`Chr3:63880612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799876.1

133 aa

133

Glutaredoxin

PF00462 Glutaredoxin 44-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799876.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	44	100	1.4e-10	42.0	Glutaredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943893.1
CACGCCCCCCATTTTCTCGCCACCCCCCGACAAAATCCCCAATTACAAATTCCCGCCCCCCCCAAAAAACCCTCCCCCACCGTGGCGATGCAAGGCCTCCGCCTCTACGACGGCGGCGTCCGCCTCGAGCTGACCCCGTCCACGGCGTCGCCGCTTGCCATCGACGTGGCGGAGACGGCGGAGACGCGCATCCAGCGCCTCATCGCCGAGAACCCCGTGATCATCTTCAGCCGCCCCTCCTGCTGCATGTGCCACGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015470
ATGCAAGGCCTCCGCCTCTACGACGGCGGCGTCCGCCTCGAGCTGACCCCGTCCACGGCGTCGCCGCTTGCCATCGACGTGGCGGAGACGGCGGAGACGCGCATCCAGCGCCTCATCGCCGAGAACCCCGTGATCATCTTCAGCCGCCCCTCCTGCTGCATGTGCCACGTCATGAAGCGCCTCCTCTCCACCGTCGGCGTCCACCCCACCGTCATCGAGCTCGACGACGACGACGAGATCGCCGCCCTCGCCCACGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799876.1
MQGLRLYDGGVRLELTPSTASPLAIDVAETAETRIQRLIAENPVIIFSRPSCCMCHVMKRLLSTVGVHPTVIELDDDDEIAALAHGGASAAPELYIGGACVGGLESLVALHLSNHLVPKLVEVGALKNEFLIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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