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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004619`

染色体: Chr03 坐标: 63895640-63897794 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004619`
名称	SmilChr03G004619
描述	heat shock factor protein HSF30-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63895640 - 63897794 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015418`
GeneID	`131015418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015418`
原始查询	`SmilChr03G004619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat shock factor protein HSF30-like
产物	heat shock factor protein HSF30-like
Arabidopsis	`AT2G26150` (HSFA2) heat shock transcription factor A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817155] identity=44.1; qcov=1.03; evalue=3.29e-91; confidence=medium
Rice	`Os07g0178600` (HSFA2B) - identity=47; qcov=0.889; evalue=1.39e-84; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799786.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799786.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799786.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799786.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63895718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:63895719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:63895738`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A23,B117,C80
`Chr3:63895738`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A23,B117,C80
`Chr3:63895740`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A23,B117,C80
`Chr3:63895740`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A23,B117,C80
`Chr3:63895744`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B133,B15,B18,B3,B6,C7,C81,D11
`Chr3:63895747`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B133,B15,B18,B3,B6,C7,C81,D11
`Chr3:63895759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B3,B6,C81,D11
`Chr3:63895768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr3:63895769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B21
`Chr3:63895782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B23,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799786.1

314 aa

157

314

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 32-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799786.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	32	121	3.8e-28	98.6	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943803.1
CAAAAATGGAAAGTTAACTGCTAAATTCTGCGGCGCGAAATTCAACTACCAACTAACTGGGAAAAAAAAAAATGGAAGGCGCGGCAGTGAAGGTAGAAGTCGACGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCGCGGCCGATGGAGAGCTTGTATGATCTGGGCACGCCGCCGTTCCTGACGAAGATCTTCGACATGGTGGAAGATTCCTCGACGGATTCGGTGATCTCGTGGAGCGCGGCGAGGAACAGCTTCATCGTGTGGGACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015418
ATGGAAGGCGCGGCAGTGAAGGTAGAAGTCGACGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCGCGGCCGATGGAGAGCTTGTATGATCTGGGCACGCCGCCGTTCCTGACGAAGATCTTCGACATGGTGGAAGATTCCTCGACGGATTCGGTGATCTCGTGGAGCGCGGCGAGGAACAGCTTCATCGTGTGGGACCCACACGCATTGTCCGCCGCCTTGCTCCCCAAATTCTTCAAACATGCCAACTTCTCCAGCTTCGTTCGACAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799786.1
MEGAAVKVEVDAAAAAAPRPMESLYDLGTPPFLTKIFDMVEDSSTDSVISWSAARNSFIVWDPHALSAALLPKFFKHANFSSFVRQLNTYGFRKVDADRWEFANEGFLGGKKHLLKTIKRRRNTSQSSTCHQGGGGGGGGGGGAPCVDVGRYGKEEEVERLKRDRDVLMAQVLKLKQQHRSSRERLLLIEERVRGSERKQQQITSFVAKALTNPLFLERRVGIGQKRRLDNVGGTSSDPITDDVLERLDQSEGEETIESL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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