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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004623`

染色体: Chr03 坐标: 63902401-63905152 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004623`
名称	SmilChr03G004623
描述	protein IQ-DOMAIN 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63902401 - 63905152 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015393`
GeneID	`131015393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015393`
原始查询	`SmilChr03G004623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 6
产物	protein IQ-DOMAIN 6
Arabidopsis	`AT2G26180` (IQD6) IQ-domain 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817158] identity=59.7; qcov=1.05; evalue=5.97e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0194200` - identity=52.9; qcov=1.04; evalue=1.87e-118; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057799757.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057799757.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799757.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057799757.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63902551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:63902579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:63902703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63902719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B37
`Chr3:63902724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B90,B92
`Chr3:63902736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C28
`Chr3:63902793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:63902809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:63902914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B71,C84
`Chr3:63902958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:63903048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr3:63903252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799757.1

405 aa

202

405

PF00612 IQ 88-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799757.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	88	107	6.3e-05	23.1	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943774.1
GCTCAGAAAATACTCAAGTTTGAAGTTCGAACACCCCCCCCCACCCACCCACGCCACCCCCCTAGGCCCCTACCCTCTTCTTTTCACCCTTTCTTCAATTGTCCCTTATTTAAGTTTTTATTCTTTTGAAGCAAAAAAGCAACTATTTTTCACAGCTCTTAATAGCTCTGTTTCACCTCTGTCTAAGCCGTTGCCTATCAGTTGCTTCACTCAGTCACTTCAAAGTCGCATAGATCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015393
ATGGGGGCTTCTGGAAAATGGGTTAAAGCATTGATAGGGCTTAAGAAACCTGATAAAGATGACAATGAAAAGATTAATGGAAAGAGCAAAAAATGGAGGATTTGGAGAAGTCCATCGCTGGATCTGAAAAAGCCCGCCGGAATCAACGCCGTGCCGGAATTCTCGTCGGAATCCTCATCCGTCAACAACGAGGCCTTCTCCGCCGCCGTCGCCGCCGTGGTCCGCGCGCCGCCGAAAGACTTCCGCGCCGTGCGGCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799757.1
MGASGKWVKALIGLKKPDKDDNEKINGKSKKWRIWRSPSLDLKKPAGINAVPEFSSESSSVNNEAFSAAVAAVVRAPPKDFRAVRQEWAAIRIQTAFRGFLARRALRALKGLVRLQAIVRGRQVRKQAAVTLRCMQALVRVQARVRARRVRMSVEGQAVQRLLDERHRENEALKEAEEGWCDSRGTLEEVKAKIQMRQEGAVKRERALAYSLAQKWKSSQSCDSCITVPKCQDLDKNSCGWSWLERWMVAKPWENRLMEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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