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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004630`

染色体: Chr03 坐标: 63945215-63949532 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004630`
名称	SmilChr03G004630
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63945215 - 63949532 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015354`
GeneID	`131015354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015354`
原始查询	`SmilChr03G004630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 8
产物	conserved oligomeric Golgi complex subunit 8
Arabidopsis	`AT5G11980` (AT5G11980) conserved oligomeric Golgi complex component-related / COG complex component-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831071] identity=80.7; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0538300` - identity=68.3; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0017119 (COG complex)
KEGG	-
Pfam	PF04124 (Dor1); PF08700 (VPS51_Exo84_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799711.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057799711.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057799711.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799711.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057799711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63945587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B140,B99,C52
`Chr3:63945590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B107
`Chr3:63945608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B99,C52
`Chr3:63945618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C82
`Chr3:63945633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:63945701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B72,C37,C80
`Chr3:63945710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B98,C33
`Chr3:63945785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B122,B45,C72,C8
`Chr3:63945788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B72,C37,C80
`Chr3:63945804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:63946011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B84,D1
`Chr3:63947022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799711.1

593 aa

296

593

VPS51_Exo84_N

Dor1

PF08700 VPS51_Exo84_N 30-107 aa PF04124 Dor1 34-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799711.1`	Pfam	`PF08700`	VPS51_Exo84_N	Repeat	30	107	7.5e-12	45.9	Vps51/EXO84/COG1 N-terminal
`XP_057799711.1`	Pfam	`PF04124`	Dor1	Repeat	34	367	1.7e-135	452.0	Dor1-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943728.1
TTTTTGCGCTAATAACTCATAAGAAAATACTAACCATAATAACTAATTTTTGAGGGGCCACGACACAATTTCACAAACATTGCAACACAATTCTTCAAAGTTGCAAAAACACCCTTATACTCTTGAAAATATGATGTAGGCCCCGACGAAAATTCTCACTAAAATCAGATAAAATCTCACTTTCCAGATCTCTAACACACTCCGATCAAATCCAGGGCTTTACGAATGACGGCAATGGCGTCGCCCGAAACTCCGGCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015354
ATGACGGCAATGGCGTCGCCCGAAACTCCGGCGAGCGACGACGTATCGGCGGAGATGTCGAACCTCCTCCCGCTCGCCTCCGCCGCGCAGCAGCCTTACGTCTCCGAACTCCTCTCATTTACACTCGATCGCCTCCATAAGGAACCGGAATTGCTGAGAGTAGATGCGGAGAGAATACGGCGGCAGATGCAAGAGGTGGCGGTGGGGAACTACCGCGCATTCATTGCGGCGGCGGATGCGTTGCTCGAGATCCGAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799711.1
MTAMASPETPASDDVSAEMSNLLPLASAAQQPYVSELLSFTLDRLHKEPELLRVDAERIRRQMQEVAVGNYRAFIAAADALLEIREEVSSIDKHLESLISEIPKLTSGCTEFVDSAENILEKRKMNQTLLANQSTLLDLLEIPQLMDTCVRNGNFDEALDLETFVAKLTTMHPKIPVIQALAAEVRQTTQSLLSQLLLKLRSNIQLPECLRIIGYLRRIGVFSEYEMRLQFLRCREAWLTGILDDLDQRNPYEYLKGMIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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