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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004631`

染色体: Chr03 坐标: 63952085-63955882 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004631`
名称	SmilChr03G004631
描述	U-box domain-containing protein 34
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63952085 - 63955882 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015338`
GeneID	`131015338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015338`
原始查询	`SmilChr03G004631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 34
产物	U-box domain-containing protein 34
Arabidopsis	`AT5G26150` (AT5G26150) protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832684] identity=54.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0218400` (OsRLCK68) - identity=52.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799687.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799687.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799687.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799687.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63952454`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A19,B1,B110,B32,B6,B7,B70,C10,C24,C45,C48,C53,C6,C63,C65,C67,D8
`Chr3:63952525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:63952534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63952548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:63952634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:63952653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C70,C82
`Chr3:63952755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B40
`Chr3:63952785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B79,C78
`Chr3:63952853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B42,B43
`Chr3:63952860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:63952869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C87
`Chr3:63952905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799687.1

688 aa

344

688

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 410-661 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 410-663 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799687.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	410	661	2.1e-41	142.8	Protein kinase domain
`XP_057799687.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	410	663	5.3e-41	141.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943704.1
CATAATCAAAGCGGAAGCATTTCCTCTCCCTTCATTTCCTTCTATTTTCCCCAACGCTTGCAAACCGGCGAAACTAAGAAGTGGTGGCCACGGCGGCAATGACGGTGGAGACGCCGTGAACCAGCCGACGGAAAAACCTCATTGCGTCGCCACTTCCCAATCCTAGCTGGGGAAACAGAAATCAATCAATCCAATTTGATTTCTATTTCTCATTCAACAAATCAAGCTAAACACATTCGATTAATTTCGAGAAATAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015338
ATGACGTTGGACGCTTCGTTGCAAGATCCACAAGAGAGCAACGCCGTCACCGTCGTCGCCGTCAGCAAGGGCAAGAGCAGTCCGTTAACCGTGAGATGGGCGATCGATAACCTTCTCAATTCTAGGCACACTCTCATTCTGGCGCACGTTAGGACTAGACATCATCACCATCACGGCCAGCACGGCGGCGCTGCGGCGGAGGCGAACGGCGGAGCAGTTGATGACATATTCGCAGCTTGTCGCGCTTGTTGTGCACGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799687.1
MTLDASLQDPQESNAVTVVAVSKGKSSPLTVRWAIDNLLNSRHTLILAHVRTRHHHHHGQHGGAAAEANGGAVDDIFAACRACCARKGVKGEEVILEGVDVHSALIDYINHNSVTNIVLSASTRNVITRFWIPDVPTMINKAAPDFCSVYVISRGKAQSIRPAARHVDSPGKVPSMVSSTRFSRAESEDHANRVSASVRGGRRDDNEYLETIRRYKNDFGDSRRRSRNMSKLLNIHEDPMAPGIKDKGMDITKVQISNTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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