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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004637`

染色体: Chr03 坐标: 63983064-63985689 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004637`
名称	SmilChr03G004637
描述	ran-binding protein 1 homolog c-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63983064 - 63985689 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015443`
GeneID	`131015443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015443`
原始查询	`SmilChr03G004637`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ran-binding protein 1 homolog c-like
产物	ran-binding protein 1 homolog c-like
Arabidopsis	`AT5G58590` (RANBP1) RAN binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835973] identity=67.8; qcov=0.91; evalue=1.47e-87; confidence=high
Rice	`Os05g0350600` - identity=73.9; qcov=0.793; evalue=1.88e-89; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006913 (nucleocytoplasmic transport)
KEGG	-
Pfam	PF00638 (Ran_BP1); PF22972 (EVH1_PP4R3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799835.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799835.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057799835.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799835.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63983386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B32
`Chr3:63983387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:63983459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B21,C37
`Chr3:63983493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B60,C42,C62
`Chr3:63983519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C13
`Chr3:63984173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C13
`Chr3:63984184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:63984660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C37
`Chr3:63984702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C57,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799835.1

222 aa

111

222

Ran_BP1

EVH1_PP4R3

PF00638 Ran_BP1 44-162 aa PF22972 EVH1_PP4R3 58-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799835.1`	Pfam	`PF00638`	Ran_BP1	Domain	44	162	2e-43	148.3	RanBP1 domain
`XP_057799835.1`	Pfam	`PF22972`	EVH1_PP4R3	Domain	58	163	8.1e-07	30.2	EVH1-like domain in PP4R3 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943852.1
ACCTAATCCAAATTCCAAAGCCCAGTTTCTCATGGCGGAGAACCCAAGTTCAATGGGCCTGTCGAAACCCTTATAAAGGGATTCCCTTCTCCCTTTTTTCTCGCTCTTCATCAGTCATCACTTTCACTTCTCTTCAATTCTAGTAACTGCTAAACCCTAGCCCTACGCCGGATCTCTCGCTTTTTCTCTCTACCTTTTTCTGCTTCATTTCCTTTCCGTAGATCGTTAATGGCGAGCACAACGGAGCCGACAGCTCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015443
ATGGCGAGCACAACGGAGCCGACAGCTCTGAAGAGAGAAGAAGAGGAGGAGGACGATTCGAAGCCATCGGCTGAAGATGAGGATACCGGAGCTCAGGTTGCTCCGATCGTTAAACTCCAGGAAGTTGCCGTTACAACGGGCGAAGAGAATGAAGATGTTCTCCTCGATTTGAAAGCAAAGTTGTATAGATTTGACAAGGACGGTAACCAATGGAAAGAGAGGGGAGTTGGAATGGTGAAGCTACTCAAGCACAAGGATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799835.1
MASTTEPTALKREEEEEDDSKPSAEDEDTGAQVAPIVKLQEVAVTTGEENEDVLLDLKAKLYRFDKDGNQWKERGVGMVKLLKHKDTGKIRLVMRQSKTLKICANHLVLPTMSLQEHHGNEKSCVWHAADFTDGELKEETFCIRFASVENCKSFKDKIEEITESLANDGGESAEADAAANLIEKLSVEEKGKEEKSEAKEEPTLKEEKKDETENQEKSGDDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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