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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004638`

染色体: Chr03 坐标: 63986087-63988410 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004638`
名称	SmilChr03G004638
描述	thioredoxin-like protein YLS8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63986087 - 63988410 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015466`
GeneID	`131015466`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015466`
原始查询	`SmilChr03G004638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like protein YLS8
产物	thioredoxin-like protein YLS8
Arabidopsis	`AT5G08290` (YLS8) mRNA splicing factor, thioredoxin-like U5 snRNP [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830725] identity=97.1; qcov=1; evalue=7.21e-72; confidence=high
Rice	`Os10g0486600` (DIM1) - identity=97.1; qcov=1; evalue=1.4e-71; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF02966 (DIM1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015466

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799869.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799871.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057799869.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057799871.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63986468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B60,C42,C62
`Chr3:63986566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:63986567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:63986621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr3:63986630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C57,C77
`Chr3:63988228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B122
`Chr3:63988255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B124,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799869.1

142 aa

142

DIM1

Thioredoxin

PF02966 DIM1 4-136 aa PF00085 Thioredoxin 17-102 aa

XP_057799871.1

102 aa

102

DIM1

PF02966 DIM1 1-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799869.1`	Pfam	`PF02966`	DIM1	Domain	4	136	3.1e-68	228.4	Mitosis protein DIM1
`XP_057799869.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	17	102	7e-06	26.7	Thioredoxin
`XP_057799871.1`	Pfam	`PF02966`	DIM1	Domain	1	96	1.8e-47	161.2	Mitosis protein DIM1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943886.1
TTTTGAGGGAAATAGTTTAAAGCAGGATTCCGCGCGAATCTTCCAGAGCCTTCTTCACCCAAAGCCAAAATCACTACGAAATTCGATTTGTCTGTTGATTTTTTCTGCGCTGAGATACCGCAAACGATGTCGTACTTGCTGCCGCATCTTCACTCCGGATGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTCGCGGAGGAGGAGCGCCTCGTCATCATCCGTTTCGGCCACGATTGGGACGATACCTGCATGCAGATGGATGAGGTGCT...

XM_057943888.1
CGTCATCATCCGTTTCGGCCACGATTGGGACGATACCTGCATGCAGTCTCTACACATAAGGATTCGATAAACCTCTGGTTTACGAAGTTGACTCGTTGAAGAGCCAAAGCAACAAAAGTCCACAAATAGCAGTCGCATCTGATGGATGAGGTGCTGGCTTCGGTTGCTGAAACGATCAAGAACTTTGCCGTCATATACCTGGTGGATATCACAGAAGTGCCCGATTTCAACACAATGTACGAGCTGTACGACCCTTCGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015466
ATGTCGTACTTGCTGCCGCATCTTCACTCCGGATGGGCCGTCGATCAGGCGATTCTCGCGGAGGAGGAGCGCCTCGTCATCATCCGTTTCGGCCACGATTGGGACGATACCTGCATGCAGATGGATGAGGTGCTGGCTTCGGTTGCTGAAACGATCAAGAACTTTGCCGTCATATACCTGGTGGATATCACAGAAGTGCCCGATTTCAACACAATGTACGAGCTGTACGACCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTCAGGAA...

LOC131015466
ATGGATGAGGTGCTGGCTTCGGTTGCTGAAACGATCAAGAACTTTGCCGTCATATACCTGGTGGATATCACAGAAGTGCCCGATTTCAACACAATGTACGAGCTGTACGACCCTTCGACTGTCATGTTCTTCTTCAGGAACAAGCACATTATGATCGATCTCGGCACTGGAAACAACAACAAGATCAACTGGGCGATGAAGGATAAGCAGGAATTCGTCGACATCGTTGAGACGGTGTATCGTGGTGCCAGAAAGGGACG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799869.1
MSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERLVIIRFGHDWDDTCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYLVDITEVPDFNTMYELYDPSTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMKDKQEFVDIVETVYRGARKGRGLVIAPKDYSTKYRY

XP_057799871.1
MDEVLASVAETIKNFAVIYLVDITEVPDFNTMYELYDPSTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMKDKQEFVDIVETVYRGARKGRGLVIAPKDYSTKYRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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