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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004652`

染色体: Chr03 坐标: 64047639-64050128 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004652`
名称	SmilChr03G004652
描述	uncharacterized SmilChr03G004652
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64047639 - 64050128 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015414`
GeneID	`131015414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015414`
原始查询	`SmilChr03G004652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RWP-RK domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831467]; symbol=AT5G16100; hit=AT5G16100; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RWP-RK domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831467]; symbol=AT5G16100; hit=AT5G16100; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G16100` (AT5G16100) RWP-RK domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831467] identity=33.2; qcov=0.825; evalue=1.3e-34; confidence=low
Rice	`Os09g0549450` - identity=29; qcov=0.373; evalue=3.56e-11; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF02042 (RWP-RK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799781.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799781.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799781.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799781.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64047777`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B2,B37,B99
`Chr3:64047777`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B2,B37,B99
`Chr3:64047795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B15,C5,C7
`Chr3:64047852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:64047885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr3:64047898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B121,B56,B84,B96
`Chr3:64048142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C78
`Chr3:64048152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:64048727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B37,B99
`Chr3:64048866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:64048883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:64049564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799781.1

332 aa

166

332

RWP-RK

PF02042 RWP-RK 237-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799781.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	237	329	4e-25	88.5	RWP-RK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943798.1
TACTAACCGCCTCAACATTCCCGCCACTTCCCTTATAATTCCCCAACTTTCAATTCCATTTCTCCTTTTTTCCGACCCCATCAATTCCATTCCGATCAACAGAAAAAAACTACTCCACTGTAACACAAACGCCAACAAAGCCCGCCGCCGCGGCGCTTGGTTAACGCCAAGCGTCGCCACCACCGCGGCCGCCGCCGGCCGCCCACACAAATGGCGGACCAAATTTCCGTTGCTCCACAACACAATCACCAACACGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015414
ATGGCGGACCAAATTTCCGTTGCTCCACAACACAATCACCAACACGCCACCGGCGCGATTTCCAGCGTAGAACAGTTACTGTTTCTCGACGACGATGACGGCGGCCGCGGCAACCCTTTGCTCGACGACGTCGTAAATGGAATGATCGAGGAGATGAGCGGCGACGCAAATTACGGCACTAATTCTCCTCAATTTTGCTCTGTTCATGAAAACGCCGTCAGCAACCAAACTGCGCAGTTTGCCGATATTCCGCCGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799781.1
MADQISVAPQHNHQHATGAISSVEQLLFLDDDDGGRGNPLLDDVVNGMIEEMSGDANYGTNSPQFCSVHENAVSNQTAQFADIPPPPAFGNPMRVPVWPVPPSPYSCSCCQTLREIFHVNGSRVLKLGIHGRLWHISHAVLERFDSKSSPENHEYYMFDFCNESIGNVKQFLIQYCNDRKLEGFIMLQDPLSNFYDALCTGCFHHHQSLQGDGHEGEVSRLEEEANGVRLPKSYIASQRERAGKMRLRDLAKYFHLPINA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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