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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004655`

染色体: Chr03 坐标: 64058352-64058957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004655`
名称	SmilChr03G004655
描述	uncharacterized SmilChr03G004655
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64058352 - 64058957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019174`
GeneID	`131019174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019174`
原始查询	`SmilChr03G004655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312]; symbol=AT2G27660; hit=AT2G27660; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312]; symbol=AT2G27660; hit=AT2G27660; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G27660` (AT2G27660) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312] identity=26.4; qcov=0.811; evalue=1.53e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803842.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057803842.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803842.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803842.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64058357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:64058377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C13
`Chr3:64058383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C13,C37,D10
`Chr3:64058399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:64058432`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B42,B43,B59,C1,C14,C34,C41,C50,C8,C81
`Chr3:64058456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C16,C61
`Chr3:64058469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B50,B97,C13,C37
`Chr3:64058547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:64058550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:64058598`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A15,A9,B129,C33,C36,C79
`Chr3:64058599`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr3:64058599`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803842.1

201 aa

100

201

C1_2

PF03107 C1_2 17-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803842.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	17	64	1.1e-14	55.2	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947859.1
ATGGCGTGCTTCCGCTTGCCATCTCGCCTCCCCTCCATTCCACTCCACCACCAATCTGGTCACCACCTCATTCTCAAATCTTCTCACAAACTTCCATCCGAGGAGTGGGAGTGCAAGGTGTGTTCTCTCAAGTCAAGTGGGCTGTTCTACGCTTGTACAAAATGCGACTTCAGAGCAGACATCAAGTGCGCTTCTCTGCCGGCCGCCATATATCACACGGCTCACCCACAACATCCCCTCGACTTTCTCCCTAGCGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019174
ATGGCGTGCTTCCGCTTGCCATCTCGCCTCCCCTCCATTCCACTCCACCACCAATCTGGTCACCACCTCATTCTCAAATCTTCTCACAAACTTCCATCCGAGGAGTGGGAGTGCAAGGTGTGTTCTCTCAAGTCAAGTGGGCTGTTCTACGCTTGTACAAAATGCGACTTCAGAGCAGACATCAAGTGCGCTTCTCTGCCGGCCGCCATATATCACACGGCTCACCCACAACATCCCCTCGACTTTCTCCCTAGCGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803842.1
MACFRLPSRLPSIPLHHQSGHHLILKSSHKLPSEEWECKVCSLKSSGLFYACTKCDFRADIKCASLPAAIYHTAHPQHPLDFLPSERQRDQHNQMFRDLLNHCLLNDPYGERRNQYSTVMKLLQRNYAEIQIYCDAMCGNAAHHYDCYACGSCEFIVHVRCATLLPASTSSRRWDKHHPLLLTHDANLNYPGEFYCDACET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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