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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004656`

染色体: Chr03 坐标: 64062428-64063687 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004656`
名称	SmilChr03G004656
描述	uncharacterized SmilChr03G004656
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64062428 - 64063687 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019175`
GeneID	`131019175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019175`
原始查询	`SmilChr03G004656`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819044]; symbol=AT2G44370; hit=AT2G44370; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819044]; symbol=AT2G44370; hit=AT2G44370; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G44370` (AT2G44370) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819044] identity=35; qcov=0.469; evalue=6.9e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=31.2; qcov=0.34; evalue=6.61e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803843.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057803843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64062490`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B120,B134,B47,B76,B77,B94,C36,C37,C53,C57,C70,C77,C86,C9
`Chr3:64062565`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B95,C26,C59,C9
`Chr3:64062565`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B95,C26,C59,C9
`Chr3:64062568`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A1,B95,C26,C59,C9
`Chr3:64062568`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A1,B95,C26,C59,C9
`Chr3:64062603`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B2,B62,B63,B65,B86,C35,C45,C58,C61,C64,C66,C71
`Chr3:64062630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C26
`Chr3:64062792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C2
`Chr3:64062845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:64062869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:64062877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:64062887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803843.1

377 aa

188

377

C1_2

PF03107 C1_2 134-181 aa PF03107 C1_2 192-235 aa PF03107 C1_2 249-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803843.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	134	181	3.9e-28	98.2	C1 domain
`XP_057803843.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	192	235	3.9e-28	98.2	C1 domain
`XP_057803843.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	249	296	3.9e-28	98.2	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947860.1
ATGGAGCTCCCAATAAGTGATGTGGGTCATGTGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGATAAAAGGAGGAGCTATATCAATACCTCATCATGATGTTGATTATGAGTTCCACAATCACAAACTCAGATTAGTCTCATCATTTCCAAAAGAAGAAGAAAATAGTGATGATGATGATGATGATGATGATTGGAAAGATCAAGAATCGGAATTAATATGTGATGGGTGCATTACTCCTATATTCAGCCGGAAACAAAGACCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019175
ATGGAGCTCCCAATAAGTGATGTGGGTCATGTGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGATAAAAGGAGGAGCTATATCAATACCTCATCATGATGTTGATTATGAGTTCCACAATCACAAACTCAGATTAGTCTCATCATTTCCAAAAGAAGAAGAAAATAGTGATGATGATGATGATGATGATGATTGGAAAGATCAAGAATCGGAATTAATATGTGATGGGTGCATTACTCCTATATTCAGCCGGAAACAAAGACCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803843.1
MELPISDVGHVELIGGLVKIKGGAISIPHHDVDYEFHNHKLRLVSSFPKEEENSDDDDDDDDWKDQESELICDGCITPIFSRKQRPSSSTSSSSSSSSSRKYYYYMSCSSGCNYNLHMACFRLPSRLPSIPLHHQSGHHLILKSSHKLPSEEWECKVCSLISSGLFYACTKCNFRADIKCASLPATIYHTAHQQHPLDFQPSWQLIYCDAMCGDSLYGNSYACGSCEFIVHVPCAILPESITSRRWDKHHRLLLTYDANL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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