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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004658`

染色体: Chr03 坐标: 64066291-64067599 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004658`
名称	SmilChr03G004658
描述	uncharacterized SmilChr03G004658
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64066291 - 64067599 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015398`
GeneID	`131015398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015398`
原始查询	`SmilChr03G004658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823833]; symbol=AT3G46800; hit=AT3G46800; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823833]; symbol=AT3G46800; hit=AT3G46800; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G46800` (AT3G46800) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823833] identity=29.7; qcov=0.613; evalue=1.76e-19; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799762.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799762.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057799762.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799762.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64066412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B58,B60,B98
`Chr3:64066437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C24,C82
`Chr3:64066592`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr3:64066592`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr3:64066601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C15,C18,C2
`Chr3:64066646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:64066672`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B17,C5
`Chr3:64066672`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B17,C5
`Chr3:64066691`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr3:64066691`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr3:64066742`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A5,B100,B107,B138,B16,B21,B48,B58,B86,C15,C18,C2,C45,C59,C65,D7
`Chr3:64066745`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A5,B100,B107,B138,B16,B21,B48,B58,B86,C15,C18,C2,C45,C59,C65,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799762.1

390 aa

195

390

C1_2

PF03107 C1_2 131-180 aa PF03107 C1_2 261-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799762.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	131	180	2.2e-23	83.0	C1 domain
`XP_057799762.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	261	309	2.2e-23	83.0	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943779.1
ATGAGAAAGGAATGTTGAAGTTCCCAATAAGTGATGTGGGTGAGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGAGAGAAGGAGGAGCTATATCAATACCTCATCATGATGAAGATTATAAGTTCCACAATCACAAACTCCGATTAGCAGTACTCTCATTATCTCGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAATAGTGATAATGATGATGAGAAAGATGATCAAGAATCAGAATTAATATGTGATGGGTGCATTACTCCTATATTCAACCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015398
ATGTTGAAGTTCCCAATAAGTGATGTGGGTGAGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGAGAGAAGGAGGAGCTATATCAATACCTCATCATGATGAAGATTATAAGTTCCACAATCACAAACTCCGATTAGCAGTACTCTCATTATCTCGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAATAGTGATAATGATGATGAGAAAGATGATCAAGAATCAGAATTAATATGTGATGGGTGCATTACTCCTATATTCAACCGGAAACAGAGACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799762.1
MLKFPISDVGEELIGGLVKREGGAISIPHHDEDYKFHNHKLRLAVLSLSREEEEEENSDNDDEKDDQESELICDGCITPIFNRKQRPSSSSSSSSSSKDYYYMSCSSGCNYNLHMACFRLPSRLPSIPLHHQSGHHLILKSSHKLPSEEWKCDVCSLQSSGLFYTCTNIFCLFRADIKCASLPATIYHTAHPQHPLYFQPHGKIRWTLLRPVRQKIYCDAMCGHAAYNYGCNYACGSCEFIVHVRCATLPASTSSRRWDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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