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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004659`

染色体: Chr03 坐标: 64080612-64082060 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004659`
名称	SmilChr03G004659
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64080612 - 64082060 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015403`
GeneID	`131015403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015403`
原始查询	`SmilChr03G004659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BIG GRAIN 1-like B
产物	protein BIG GRAIN 1-like B
Arabidopsis	`AT1G54200` (AT1G54200) DNA mismatch repair Msh6-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841860] identity=39.4; qcov=1.01; evalue=2.62e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0175800` (BG1) - identity=33.7; qcov=0.557; evalue=1.17e-11; confidence=low
GO	GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF30505 (Big_grain_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799767.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799767.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799767.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799767.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64080794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C49
`Chr3:64080870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64080871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B45,C72,C80
`Chr3:64080873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:64080929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:64081033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C23,C82
`Chr3:64081157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:64081185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:64081269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:64081328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:64081437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:64081525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B22,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799767.1

368 aa

184

368

Big_grain_1

PF30505 Big_grain_1 19-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799767.1`	Pfam	`PF30505`	Big_grain_1	Domain	19	251	1.5e-25	91.3	BIG GRAIN 1 auxin transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943784.1
CCCATTCTCTTCCATTCATCTTCAACCTCAAGCTCCTTCTCTCTCATCCCACTCTCTCTCTACACTCCCTCCCCTCTCTTCATACCCCCTTTGCCTCCCACCCTTTCTCTCCTACGCCCCCAAAAAACCTCATTTCTGCGTCAAAGCAAAAATGTATGCTCGAGAAAAACTATGCAACAAATCAAGAAAATCCGACAAAGATATTCCGCCGCCGTCATTCTCCTCCACTCTCCTCGACGAAATCTACCGCTCAATCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015403
ATGTATGCTCGAGAAAAACTATGCAACAAATCAAGAAAATCCGACAAAGATATTCCGCCGCCGTCATTCTCCTCCACTCTCCTCGACGAAATCTACCGCTCAATCGACGGGAGCGTCGAGAAATCCGATGATCTCAACGGCTATAAAGAAGCGGCGAGCTCTCGAAGAGCATGCTTGGTCGAGAAATGGATGGAGAAAGAGGCCAACGAGAGAGCCGCCGCGAGAAGAAAGAGACAGCAGTTTCTGCGAGAATCCGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799767.1
MYAREKLCNKSRKSDKDIPPPSFSSTLLDEIYRSIDGSVEKSDDLNGYKEAASSRRACLVEKWMEKEANERAAARRKRQQFLRESDTKSAAHDSDVIFFSSTSSSSDSSGALSSSDTEFFGSTGGRSKPKVSCFTARPKPVRTGSRSEPDRFKPDDRQDDLIKSKSRALKIYANLKKVKQPISPGGRLTSFINSLFSNAGGKKSRSLEARDDRSVAACSSASSFSRSCLSKYSPRSREKMRDGGERRTVKFEPAVVDRDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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