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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004667`

染色体: Chr03 坐标: 64135070-64136872 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004667`
名称	SmilChr03G004667
描述	trihelix transcription factor GTL1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64135070 - 64136872 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015402`
GeneID	`131015402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015402`
原始查询	`SmilChr03G004667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor GTL1-like
产物	trihelix transcription factor GTL1-like
Arabidopsis	`AT1G76880` (AT1G76880) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844023] identity=41.3; qcov=0.204; evalue=1.54e-12; confidence=weak
Rice	`Os04g0541100` (GT-2) - identity=47.2; qcov=0.242; evalue=5.48e-16; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799766.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799766.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799766.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799766.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64135280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A10,A2,B66,C33,D4
`Chr3:64135280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A2,B66,C33,D4
`Chr3:64135363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:64135473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B98,C71
`Chr3:64135480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:64135620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D6
`Chr3:64135671`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A2,A3,A8,A9,B117,B122,B136,B139,B16,B2,B32,B35,B46,B49,B51,B69,B73,B79,B84,C24,C25,C28,C32,C38,C45,C53,C54,C68,C7,C75,C80
`Chr3:64135763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C1,C49
`Chr3:64136349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B137,B35,B68,C40
`Chr3:64136479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:64136586`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C40
`Chr3:64136589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943783.1
ACTTTTAAGGAGGGTTTTCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACCCCTATCACCTCTCCTCATCTTCCCAAACTCCTCCATCATCTCTCCCCTCCCAAATCCTCCACATTACTAGGGTTTCTTCCAATCTCAGCTCCAAACCAGCTCAAACACTACCCCTCTCTCTCTCTCTCACACGCACACACACTCTCTCTCTCACTTCAAGATCCGCCACCACAAAAGAAGAGATGCATTCGGGTTTCGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015402
ATGCATTCGGGTTTCGAAATCCCCGGCATCCACCACCAGCAGCACCAGCACCAGCACCAGCAGCAACCCGATAACCCGCTTCTACTATCCATGAACCCGACCCATATCCTCGACCAAATCCACGCCCTACCCACAACCCAACAACAACAGCTACCCCTCCACCACCACCACCACCACTTCCTCCCTCCCCACCACCACCACTACCCCGCCGCCTCCCCTTCCCCCTCCGCCTACTTCCCCCTCAACTTCAAGCTCGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799766.1
MHSGFEIPGIHHQQHQHQHQQQPDNPLLLSMNPTHILDQIHALPTTQQQQLPLHHHHHHFLPPHHHHYPAASPSPSAYFPLNFKLGLNEIRSRNDAAAAGGGGGGGGGDALLRGSEQYELPEARQSSLGMLHSPFWEPLPAEVSNENSEIVDRHELRQRETPTTCLDAKSRVHFSELEAIYKRLGNAETTQTAPNSAAAAAAAPLPQPVTASLPSAEEEPSGTFAKKTKRRKKRTANPICGGDPQLIGPMAEFFENLVKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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