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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004670`

染色体: Chr03 坐标: 64163545-64166279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004670`
名称	SmilChr03G004670
描述	uncharacterized SmilChr03G004670
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64163545 - 64166279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015508`
GeneID	`131015508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015508`
原始查询	`SmilChr03G004670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817174]; symbol=AT2G26340; hit=AT2G26340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817174]; symbol=AT2G26340; hit=AT2G26340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G26340` (AT2G26340) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817174] identity=52.3; qcov=0.905; evalue=3.6e-66; confidence=high
Rice	`Os03g0176700` - identity=55.4; qcov=0.794; evalue=3.71e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25306 (DUF7880)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799895.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057799895.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057799895.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799895.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64163678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B134,B58
`Chr3:64163679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B82
`Chr3:64163685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:64163698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B140,B30,C10,C82
`Chr3:64163701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,D9
`Chr3:64163744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:64163979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B93
`Chr3:64164218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B120,B134,B140,B30,B58,C10,C82
`Chr3:64164224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:64165305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:64165311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B90,B92
`Chr3:64165312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B66,C11,C69,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799895.1

243 aa

122

243

DUF7880

PF25306 DUF7880 90-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799895.1`	Pfam	`PF25306`	DUF7880	Domain	90	216	4.7e-53	179.5	Domain of unknown function (DUF7880)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943912.1
GTCGCGCCAAATGACGATCGCCTCCGGCATCATCACTGCGGCGGCGCACGGTATAACCGCACAATTCGCACTCATTCCAGGTTTGTCGCGTGCCTCGAGGTCAAATCGGCGCGCGATTAGCTCCGGCGTGAGGTGCGCATTGCTCCCGCTGAGGAGGAGGATTGAGAGCAGACGATCGGTTTCTCTCTCGCTTGTTCTCCTCCATTTCTTCGCTCTATCTAAAGATGCATTGGGTGTGAGCGCGATGGATAGATATGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015508
ATGACGATCGCCTCCGGCATCATCACTGCGGCGGCGCACGGTATAACCGCACAATTCGCACTCATTCCAGGTTTGTCGCGTGCCTCGAGGTCAAATCGGCGCGCGATTAGCTCCGGCGTGAGGTGCGCATTGCTCCCGCTGAGGAGGAGGATTGAGAGCAGACGATCGGTTTCTCTCTCGCTTGTTCTCCTCCATTTCTTCGCTCTATCTAAAGATGCATTGGGTGTGAGCGCGATGGATAGATATGTAAAAAGGAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799895.1
MTIASGIITAAAHGITAQFALIPGLSRASRSNRRAISSGVRCALLPLRRRIESRRSVSLSLVLLHFFALSKDALGVSAMDRYVKRKRLDPLEAYIPAVILTEFQIKELGQYLDDDQPEFLSCRNLLRSGPAASLRINIRAVAQYASDAGNGKYAFDEVDQCLRALEELDSLLLRASRKDSSSSVEAMKARVVTALNALNSLLKTVPAEVLDKGKAMADAYMNPGDDTSPETLDPQLKQLESIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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