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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004672`

染色体: Chr03 坐标: 64170937-64175344 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004672`
名称	SmilChr03G004672
描述	uncharacterized SmilChr03G004672
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64170937 - 64175344 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015510`
GeneID	`131015510`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015510`
原始查询	`SmilChr03G004672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159]; symbol=AT2G06040; hit=AT2G06040; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159]; symbol=AT2G06040; hit=AT2G06040; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06040` (AT2G06040) F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159] identity=42.7; qcov=0.788; evalue=1.55e-135; confidence=medium
Rice	`Os08g0459100` - identity=46.7; qcov=0.587; evalue=2.1e-121; confidence=medium
GO	GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF13516 (LRR_6); PF25372 (LRR_FBXL15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015510

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799897.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799897.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799897.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799897.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64171699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:64171762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C56
`Chr3:64171778`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A16,A25,A4,B100,B126,B2,B26,B27,B32,B47,B54,B62,B71,B73,B8,B87,B9,B94,C43,C5,C62,C74,C78,C85,D3
`Chr3:64171782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64171884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B90,B92
`Chr3:64172250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:64172254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B64,C76
`Chr3:64172258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:64172732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:64173800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B77,B82
`Chr3:64173846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:64173861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B27,B98,C33,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799897.1

758 aa

379

758

LRR_FBXL15

LRR_6

PF25372 LRR_FBXL15 565-714 aa PF13516 LRR_6 669-688 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799897.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	565	714	1.2e-11	44.4	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057799897.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	669	688	1.1e-05	25.8	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943914.1
AGTGCAAAATTCCATCAAGAAGCAGGGGAAGCTATAAGTGGCAGTTCGACATTAAGCCCTCTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCTACCGCAATCTGCATTCCCCTTTCCTTAACTTTTAGCTTTCAATTTTATTTTCCCCCAATCTCAAACACTAGTCTTCGTCAATGAATTCAGATTCCCCTATATATACAGCTGCTACTGCTGCTTTCTTTATTCATATCGCGAGCAGAAGCATTTTCGATCTGACATTCCCTAAATTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015510
ATGAAGAGGATCAATGGGAATGGGGACAAGGAAGAATTGGAGGTGAAGAAAGTTAAATTCGTTTGTGAGAATGATCAGAATTTTGTCGACTTAGATAGAGATGAAGGCCAGGAAGAGAGAGTTTTAGGTTTAGCTGAGAATGGAGCTGTCAATTTCGAACAAGTTGATAGGAACACGAACCTTTTTGCTAATGTAGTCCCTGATGATCTTGATGGCTCAAGTTTTGGTGTTGTTGAGGGCTCCAATATATGGGATTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799897.1
MKRINGNGDKEELEVKKVKFVCENDQNFVDLDRDEGQEERVLGLAENGAVNFEQVDRNTNLFANVVPDDLDGSSFGVVEGSNIWDYDLNFDMFFKEEEQGLSLDLNIPLFNPSPKRRKKGLLASDQYPDRRFDNNNKEVVDLVSDDDGSEVEIVGFTNGYNQQIEPGMLSDRVKELSLELGLPSMDNGVGESSQVAGGEYRYTGEKKGKGSDMDSWLSLKSSYLVDLDPDTDIDEPVQLIEVEEEVEENVEVIQFRAELL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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