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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004685`

染色体: Chr03 坐标: 64255053-64258501 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004685`
名称	SmilChr03G004685
描述	polyadenylate-binding protein-interacting protein 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64255053 - 64258501 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015526`
GeneID	`131015526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015526`
原始查询	`SmilChr03G004685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein-interacting protein 7-like
产物	polyadenylate-binding protein-interacting protein 7-like
Arabidopsis	`AT2G26280` (CID7) CTC-interacting domain 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817168] identity=49.3; qcov=1.03; evalue=4.52e-168; confidence=high
Rice	`Os06g0199200` (B1172G12.23-1) - identity=40.6; qcov=1; evalue=1.47e-105; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08590 (DUF1771)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799914.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799914.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057799914.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799914.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64256152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:64256176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:64256194`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr3:64256194`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr3:64256254`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B135,D6
`Chr3:64256254`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B135,D6
`Chr3:64256276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:64256318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B35,B89
`Chr3:64256398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:64256399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C4,C49
`Chr3:64256457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:64256526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B32,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799914.1

542 aa

271

542

DUF1771

PF08590 DUF1771 384-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799914.1`	Pfam	`PF08590`	DUF1771	Domain	384	446	1.4e-13	51.6	Domain of unknown function (DUF1771)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943931.1
AGAGAAAATGATAAAGGAAAAGATAGAAAGTAGAAACAGTTTAGAGAGAGAGGAGATGAAGAACTGGAGATAGGAGAGAGAGTGAGAGAGAGAAGAATCCTCAGCTCAAAACTCAAGAACTACACCTCGATAGAAAAGCATCGATAGATTTCCCTCGTTTTCAGTGATTATTATACAGATGCGCACGCGCGCACACACACACACACTCAATGGCCAAATCACTCTTTACTATCTAAAATTCTATCCTGTTTGGCTTGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015526
ATGAACTTGTCAGCAAAGGGTGCTTCTGTAGCTAACAAGAAGCTTAGTGCTGAAGCAACTTTGAATCCGAATGCTGCAGAGTTCGTTCCTTTTGCTCTCAGGTCACAGGCTGCGAACCTTAGAATTCTAGATACGTCTCCAAAATTTACCACCTCGGGGAAATCTGTATTAGATAGGTCAGAATCATCAGTTTCGAATAGCTCCAATGCTGAAGAAGAGGCCCAACAGTACTGGTGTCACCAGCTCCCAGACGACATTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799914.1
MNLSAKGASVANKKLSAEATLNPNAAEFVPFALRSQAANLRILDTSPKFTTSGKSVLDRSESSVSNSSNAEEEAQQYWCHQLPDDITPDFKVMGIDNGVNEASRYTSPTNSGVTLKEHQALSLLHPLDGSTRAEKQRYPVSPNGECFQTSLGKPWDRQIHGGSDQLLAREGNPYNGNTSRAFLAEMSNEQSLLDNADLCRLEFLASQFPSFSAESIAEAYLSNGGDLNLTINVLTQLELRVDGGSNQTRSPMAFSSPNLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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