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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004686`

染色体: Chr03 坐标: 64259740-64261677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004686`
名称	SmilChr03G004686
描述	transcription factor HY5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64259740 - 64261677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015527`
GeneID	`131015527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015527`
原始查询	`SmilChr03G004686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor HY5-like
产物	transcription factor HY5-like
Arabidopsis	`AT5G11260` (HY5) Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830996] identity=61.3; qcov=0.981; evalue=2.04e-50; confidence=medium
Rice	`Os02g0203000` (OsbZIP18) - identity=63.7; qcov=0.854; evalue=1.61e-47; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0010017 (red or far-red light signaling pathway); GO:0010099 (regulation of photomorphogenesis); GO:0010114 (response to red light); GO:0010218 (response to far red light); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799915.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799915.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799915.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799915.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64259930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:64260003`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A8,B11,B133,B136,B18,B40,B43,B48,B50,B62,B74,B85,B90,B91,C3,C31,C39,C46,C54,C56
`Chr3:64260006`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A8,B11,B133,B136,B18,B40,B43,B48,B50,B62,B74,B85,B90,C3,C31,C39,C46,C54,C56
`Chr3:64260009`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A8,B11,B133,B136,B18,B40,B43,B48,B50,B62,B74,B85,B90,C3,C31,C39,C46,C54,C56
`Chr3:64261003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:64261031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B5,C45,C6,D10
`Chr3:64261034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B49,B68,C23
`Chr3:64261118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A24,B56,B96
`Chr3:64261370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B12,B4,B55,C14
`Chr3:64261400`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A23,A7,B104,B17,B26,B30,B8,B95,B98,C2,C20,C3,C30,C31,C5,C70,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799915.1

158 aa

158

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 83-136 aa PF00170 bZIP_1 83-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799915.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	83	136	1.3e-08	35.4	Basic region leucine zipper
`XP_057799915.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	83	144	2.4e-13	50.7	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943932.1
GTCTGATCAAATCTGATCCAACGGTTTCTGTAGCTTAGTTTTTCTCCCCAACTCTCTCTCTACTGTGATATTACGTCCCGCTCTTTTTTTTCTATCTCATCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCACTATCTCTCTGTGTAAATTCTTGTGTTTTGATTATGCTGATTGGCAGAGAAGAAATGCAAGAGCCAGCCACGACTACGAGTTCCATTGCGGCAAGCTCTCTGCCTTCGAGCAGCGAGAGATCTTCGAGCTCAGCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015527
ATGCTGATTGGCAGAGAAGAAATGCAAGAGCCAGCCACGACTACGAGTTCCATTGCGGCAAGCTCTCTGCCTTCGAGCAGCGAGAGATCTTCGAGCTCAGCTCTCAACAATGAAGTCAAACAAGGCATTGAGAGTGATGATGAGATAAGAAGAGTGCCGGAGATGGGCGGCGCGGCGGCGGAAAACGCCGGCGCTGCCCAGCCATCCGCCGCTGGCTCTAAGCGGAGAGGAAGAAGCCCAGCTGATAAAGAGAACAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799915.1
MLIGREEMQEPATTTSSIAASSLPSSSERSSSSALNNEVKQGIESDDEIRRVPEMGGAAAENAGAAQPSAAGSKRRGRSPADKENKRLKRLLRNRVSAQQARERKKAYLGDLEVRVKELESKNAELEERLSTFQNENQMLRKILKNTTAGPQEGRKGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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