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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004692`

染色体: Chr03 坐标: 64285803-64288252 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004692`
名称	SmilChr03G004692
描述	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64285803 - 64288252 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015533`
GeneID	`131015533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015533`
原始查询	`SmilChr03G004692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
产物	probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
Arabidopsis	`AT5G06740` (AT5G06740) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830563] identity=36.1; qcov=1.03; evalue=4.79e-126; confidence=medium
Rice	`Os02g0712700` - identity=37.3; qcov=0.96; evalue=1.23e-121; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00139 (Lectin_legB); PF03388 (Lectin_leg-like); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799921.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799921.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799921.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799921.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64285899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:64285923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64285952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:64286030`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B133,B52,C15,C24,C47,C76,D11
`Chr3:64286033`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr3:64286033`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr3:64286035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:64286064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B140,C14,C57,C77
`Chr3:64286066`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B17,C70
`Chr3:64286066`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B17,C70
`Chr3:64286123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A24,B19,B56,B96
`Chr3:64286154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799921.1

653 aa

326

653

Lectin_legB

Lectin_leg-like

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00139 Lectin_legB 22-250 aa PF03388 Lectin_leg-like 44-245 aa PF00069 Pkinase 331-529 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 334-594 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799921.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	22	250	1.3e-43	150.1	Legume lectin domain
`XP_057799921.1`	Pfam	`PF03388`	Lectin_leg-like	Domain	44	245	1e-06	29.0	Legume-like lectin family
`XP_057799921.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	331	529	9e-45	153.8	Protein kinase domain
`XP_057799921.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	334	594	2.3e-41	142.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943938.1
TGGATTTCAAGATTTGATTGGTCAAATCTAGTGAATTCTTAGTCTTGTCTTGTGTTGAAACATAAGCAAACAAGATTCAAGAATCTTTCATTGTAACAAGAGTTTTGACTCCACTAATCACACTTATAGGATAACGACGCCATAATCTTCCGCTGATAAGAATGGATTAGGCTTCTGCTGAACTCCTTTATTTATCAGCACACAGTCTTGTCTCACAAACTCTTTCTCACACACACAAGAATGGTGTTAATTCTACTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015533
ATGGTGTTAATTCTACTTATTATTTTGCTAATCCATCTAGCTTCTCCCTTCTTTGTGGGATCCCAAAACTTCTCCTTCCCAACGTTTGATTCATCAAATTGTGAGAAGGGAGGCAGTTTGATCTGTTTGGGATCAGTAAGCTGTAGCAACGGAAGCCTAACCATCACCCCGAACGGGGCGCAAGAGACGAGCCTTGTGGGACGGGTTCTATTCCGTTACCCTATTCTTGCATGGCCGGCATCCTTCTCCACCTCCTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799921.1
MVLILLIILLIHLASPFFVGSQNFSFPTFDSSNCEKGGSLICLGSVSCSNGSLTITPNGAQETSLVGRVLFRYPILAWPASFSTSFTIRVTSGSNLSGDGVAFIIAQDDKPSPPESYGSYIGIMDPSTEGGFLRQLAVEFDTYKNPRDIDKNHIAIDTIDVEHPVAVRSLNDVGIDLKSGRNIRVKIDYDGLKKILQVHVAYADEPMVSFLKQKIIMEDTVPQQAYVGFTGSTGHISETHQILDWNFTMYALPEGSLGQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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