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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004704`

染色体: Chr03 坐标: 64333455-64336742 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004704`
名称	SmilChr03G004704
描述	uncharacterized SmilChr03G004704
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64333455 - 64336742 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015544`
GeneID	`131015544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015544`
原始查询	`SmilChr03G004704`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	EEIG1/EHBP1 protein amino-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817084]; symbol=AT2G25460; hit=AT2G25460; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	EEIG1/EHBP1 protein amino-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817084]; symbol=AT2G25460; hit=AT2G25460; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G25460` (AT2G25460) EEIG1/EHBP1 protein amino-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817084] identity=38; qcov=0.967; evalue=4.45e-109; confidence=medium
Rice	`Os01g0194000` - identity=58.2; qcov=0.448; evalue=9.81e-94; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28979 (DUF8490)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799943.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799943.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799943.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057799943.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64333637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C2
`Chr3:64333716`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:64333716`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64333717`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:64333717`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64333748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C78
`Chr3:64333757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:64333814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:64333856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B114,B90,B92,C40
`Chr3:64334113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A21,C9
`Chr3:64334146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C12,C45
`Chr3:64334163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799943.1

609 aa

304

609

DUF8490

PF28979 DUF8490 324-581 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799943.1`	Pfam	`PF28979`	DUF8490	Domain	324	581	5.9e-119	396.9	Domain of unknown function (DUF8490)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943960.1
TTCAATTCCGCAATTAAAAAAGATATTAGAAAGAAATAAAGAATATTTCAATCGAGCAAATCATTCAATATATTTTTTTTTTCCACAACTTCTCATTTTTGTTTTATTTAGAGAGAGAGAGGGAATTTGTCGGAGATGGCGGTGAAGATGAGGAAGTGGTCGCCGTGGCCGCCGGCGAGGAAGTTTGCCGTGGCGGTGAGGCTAATGAGGCTCGAGGTATTGGCGGAAGACGACGGCGGCGGCGGCGGAGATGATGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015544
ATGGCGGTGAAGATGAGGAAGTGGTCGCCGTGGCCGCCGGCGAGGAAGTTTGCCGTGGCGGTGAGGCTAATGAGGCTCGAGGTATTGGCGGAAGACGACGGCGGCGGCGGCGGAGATGATGAAGACGGCGGCTCCGGCGAGGCGCAGAAATTTGTGGCGATCAAAATCAAATGGAAAGGCGAGCCGAAGCTTTTCCCGTTGATGCCGCCGTTTCAGCCGAGGAAGAAAATCGAGCAATCGAGCCACAAAATTATGACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799943.1
MAVKMRKWSPWPPARKFAVAVRLMRLEVLAEDDGGGGGDDEDGGSGEAQKFVAIKIKWKGEPKLFPLMPPFQPRKKIEQSSHKIMTKNCGIVEWDEDLWFENTCCFSVVSDKKFGPWEIAFNVICGEKVDSKAKMSTIGGVSINISEVIWKMESSSIEEKLHLNLQIDGIARDANLTVMFNFVEIRESQDSSAISRTKSIDVKYLHAHERKDNVRARRRSLSLEEVCLDEPDTAHAKSRGPVVGLEPDKKDRWFTWKSRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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