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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004714`

染色体: Chr03 坐标: 64390472-64393314 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004714`
名称	SmilChr03G004714
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g49040
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64390472 - 64393314 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015554`
GeneID	`131015554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015554`
原始查询	`SmilChr03G004714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g49040
产物	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g49040
Arabidopsis	`AT5G56690` (AT5G56690) FBD, F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835770] identity=28; qcov=0.543; evalue=2.26e-15; confidence=low
Rice	`Os06g0161300` (OsFbox297) - identity=25.6; qcov=0.918; evalue=2.24e-18; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799957.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799957.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799957.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799957.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64390572`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B89
`Chr3:64390572`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B89
`Chr3:64390780`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A7,B120,C16
`Chr3:64390780`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A7,B120,C16
`Chr3:64390901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C76
`Chr3:64390907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B30,C68,C81
`Chr3:64390989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:64391042`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B42,D1,D9
`Chr3:64391042`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B42,D1,D9
`Chr3:64391045`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	B42,D1,D9
`Chr3:64391045`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B42,D1,D9
`Chr3:64391078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799957.1

486 aa

243

486

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 24-59 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 107-412 aa PF24758 LRR_At5g56370 117-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799957.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	59	2.6e-06	27.8	F-box domain
`XP_057799957.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	107	412	6.6e-16	59.4	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057799957.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	117	259	1.8e-11	44.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943974.1
CTTTAAATTCATTCATGCATATCTTTTTAGTTTACGCGGAAGAATTCGTCGTGTGATTTAGGAAGAGAAAATTTATCGTCTTTTCCGATGGAAAAATCCAGAAATAGAAAGCAACAACAGATGGTAATGGATGATGGTGTGAATAATGGTGGTGATATTGATAGGTTGCCTAATGATTTAGTAATTAAGATTCTGTCACACATGAGCATCAAGAGAGCTGCGAGGACTAGTGTCCTCGCGCATAGATGGAGATATCTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015554
ATGGAAAAATCCAGAAATAGAAAGCAACAACAGATGGTAATGGATGATGGTGTGAATAATGGTGGTGATATTGATAGGTTGCCTAATGATTTAGTAATTAAGATTCTGTCACACATGAGCATCAAGAGAGCTGCGAGGACTAGTGTCCTCGCGCATAGATGGAGATATCTTTGGAGGTTTTCCCATGGGACTCTTGGATTTGATGGAAAACTAATGGAAAAGGAAAAGTTCGAGTCTTGGGTGAATGGTGTGCTGGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799957.1
MEKSRNRKQQQMVMDDGVNNGGDIDRLPNDLVIKILSHMSIKRAARTSVLAHRWRYLWRFSHGTLGFDGKLMEKEKFESWVNGVLDLHQAPYIEGMIISFEGGVEIHEKASTSRAVERWLNFAMQKQVQRLELNLSFQDMYKTESPTVRYVFPTPDELRSHSHSFCRLRSLRLSHVHIRNDVVHYFLASCPNLEELCIQFSDYIKGNLRVADPPSLRVLEITGCTYVKSLEISAVSLVSLTYGGPKNSLLLKKAPNLREL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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