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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004720`

染色体: Chr03 坐标: 64420713-64426733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004720`
名称	SmilChr03G004720
描述	PX domain-containing protein EREL2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64420713 - 64426733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015560`
GeneID	`131015560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015560`
原始查询	`SmilChr03G004720`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PX domain-containing protein EREL2
产物	PX domain-containing protein EREL2
Arabidopsis	`AT4G32160` (AT4G32160) Phox (PX) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829348] identity=52.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0643000` - identity=42.5; qcov=1.06; evalue=6.71e-156; confidence=medium
GO	GO:0015031 (protein transport); GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	-
Pfam	PF00787 (PX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799968.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057799968.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057799968.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799968.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057799968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64421140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:64421451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C8
`Chr3:64421990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr3:64422220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:64423453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C31,C70
`Chr3:64423552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B65,C57,C77
`Chr3:64423576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:64423628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B78
`Chr3:64423729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:64423750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:64423792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B69,B71,B85
`Chr3:64423842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799968.1

706 aa

353

706

PF00787 PX 83-158 aa

XP_057799969.1

704 aa

352

704

PF00787 PX 83-158 aa

XP_057799970.1

703 aa

352

703

PF00787 PX 83-158 aa

XP_057799971.1

701 aa

350

701

PF00787 PX 83-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799968.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	83	158	6.7e-17	62.5	PX domain
`XP_057799969.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	83	158	7e-17	62.5	PX domain
`XP_057799970.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	83	158	6.7e-17	62.5	PX domain
`XP_057799971.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	83	158	7e-17	62.5	PX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943988.1
AAAAATAAAACCATCGAAGCAATCGATCCTCTCCGGTGCCTGCTTTCCAGTACCGTCCGATGCGAGTTAGAGGTGATTTTAGCCGCACGATATTCTAAAAAACGTGGTGCATATCAGAAGAAAAATGACAAAAATGGAGGAGAAATCGTGAAGCCGAAGCAGCGCACCACCTGCGCTTTGTAGCCACCTCCCCCACTTTCTCCTTCTCTCATCCCGCTGCCGGGGGCTATCGTGCGCCCTCTGATCCCAATCTCTCAAAA...

XM_057943986.1
AAAAATAAAACCATCGAAGCAATCGATCCTCTCCGGTGCCTGCTTTCCAGTACCGTCCGATGCGAGTTAGAGGTGATTTTAGCCGCACGATATTCTAAAAAACGTGGTGCATATCAGAAGAAAAATGACAAAAATGGAGGAGAAATCGTGAAGCCGAAGCAGCGCACCACCTGCGCTTTGTAGCCACCTCCCCCACTTTCTCCTTCTCTCATCCCGCTGCCGGGGGCTATCGTGCGCCCTCTGATCCCAATCTCTCAAAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131015560
ATGCAGGGGCCGAGTCCACCGAAGCACCGCCACGATGGGACTTCGCCTTTGCCGTTGGGAATGGATTGGAGCCCTCCGCCTCGAATTTGGGCAGGGAGAGAAAGTGTTTGGCCTCATGATTCTCGATCAGGATGGAGTTACTGCATCACTGTACCTTCATGGATTGTACTTGCAAAATCAAGAGATTCTGACCCAACAGTGTTTTACAGGGTTCAGGTTGGCATACAATCACCGGAGGGGATTACGACCACAAGAACTGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057799968.1
MQGPSPPKHRHDGTSPLPLGMDWSPPPRIWAGRESVWPHDSRSGWSYCITVPSWIVLAKSRDSDPTVFYRVQVGIQSPEGITTTRTVLRRFNDFLKLHAALKRAFPRKSIPPAPPKGLLRMKTRAMLEARRSSLEEWMTNLLSDIDLSRSIVVASFLELEAAARSSFQEEGQQSSDSHISVTTTDPSPHIHPHSSMLAAASSSVTSDYGSDTAYEISDIGSPSLGRDNNSEVGTEDLSFDDDATSPVDKFVKYGMSNIDE...

XP_057799969.1
MQGPSPPKHRHDGTSPLPLGMDWSPPPRIWAGRESVWPHDSRSGWSYCITVPSWIVLAKSRDSDPTVFYRVQVGIQSPEGITTTRTVLRRFNDFLKLHAALKRAFPRKSIPPAPPKGLLRMKTRAMLEARRSSLEEWMTNLLSDIDLSRSIVVASFLELEAAARSSFQEEGQQSSDSHISVTTTDPSPHIHPHSSMLAAASSSVTSDYGSDTAYEISDIGSPSLGRDNNSEVGTEDLSFDDDATSPVDKFVKYGMSNIDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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