当前解析结果
SmilChr03G004732| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004732 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004732 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004732 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 64481835 - 64483162 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015582 |
|---|---|
| GeneID | 131015582 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015582 |
| 原始查询 | SmilChr03G004732 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015582 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799999.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057799999.1 |
| 3 | Nucleolus | 核仁 | 0.40000 | XP_057799999.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057799999.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799999.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:64482005 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr3:64482114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:64482500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B32,B58,B69,C12,C81 |
Chr3:64482630 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr3:64482652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:64482744 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B76 |
Chr3:64482786 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:64482820 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,C82 |
Chr3:64482857 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 38 | A25,B100,B104,B11,B111,B112,B118,B135,B138,B19,B22,B35,B37,B38,B39,B41,B49,B50,B58,B78,B84,B85,B88,B90,B92,B97,C13,C17,C28,C3,C30,C35,C38,C40,C44,C51,C74,D3 |
Chr3:64482859 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A25,B100,B104,B11,B111,B118,B135,B138,B19,B22,B35,B37,B38,B39,B41,B49,B50,B58,B78,B84,B85,B88,B90,B92,B97,C13,C17,C28,C3,C30,C35,C38,C40,C44,C51,C74,D3 |
Chr3:64482907 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 87 | A1,A15,A18,A23,A5,A6,A7,A9,B10,B103,B106,B109,B11,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B126,B127,B129,B130,B133,B137,B138,B139,B18,B23,B29,B3,B34,B4,B42,B43,B48,B57,B6,B62,B66,B70,B71,B73,B75,B77,B81,B83,B91,B93,B95,C10,C15,C16,C18,C19,C22,C25,C26,C32,C33,C40,C41,C43,C47,C5,C52,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C65,C68,C7,C70,C77,C78,C80,C82,C85,C87,C9,D11,D3,D5 |
Chr3:64482910 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 87 | A1,A15,A18,A23,A5,A6,A7,A9,B10,B103,B106,B109,B11,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B126,B127,B129,B130,B133,B137,B138,B139,B18,B23,B29,B3,B34,B4,B42,B43,B48,B57,B6,B62,B66,B70,B71,B73,B75,B77,B81,B83,B91,B93,B95,C10,C15,C16,C18,C19,C22,C25,C26,C32,C33,C40,C41,C43,C47,C5,C52,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C65,C68,C7,C70,C77,C78,C80,C82,C85,C87,C9,D11,D3,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。