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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004742`

染色体: Chr03 坐标: 64542658-64548183 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004742`
名称	SmilChr03G004742
描述	uncharacterized SmilChr03G004742
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64542658 - 64548183 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015592`
GeneID	`131015592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015592`
原始查询	`SmilChr03G004742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	neurochondrin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829336]; symbol=AT4G32050; hit=AT4G32050; species=arabidopsis; confidence=high
产物	neurochondrin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829336]; symbol=AT4G32050; hit=AT4G32050; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G32050` (AT4G32050) neurochondrin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829336] identity=51.8; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0798700` - identity=47.8; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05536 (Neurochondrin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800010.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800010.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057800010.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800010.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64542853`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B112,B117,B76,C24,C49,C61,C81
`Chr3:64543318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B76
`Chr3:64543350`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr3:64543350`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr3:64543849`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	134	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A24,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B100,B101,B103,B108,B110,B111,B114,B120,B124,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B2,B21,B24,B28,B30,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B52,B53,B54,B56,B61,B63,B65,B68,B73,B75,B76,B77,B8,B81,B83,B85,B86,B9,B96,B99,C1,C10,C13,C14,C16,C17,C20,C21,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C60,C61,C68,C72,C73,C74,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C86,C9,D10,D11,D3,D5,D6,D8
`Chr3:64543851`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	134	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A24,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B100,B101,B103,B108,B110,B111,B114,B120,B124,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B2,B21,B24,B28,B30,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B52,B53,B54,B56,B61,B63,B65,B68,B73,B75,B76,B77,B8,B81,B83,B85,B86,B9,B96,B99,C1,C10,C13,C14,C16,C17,C20,C21,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C58,C6,C60,C61,C68,C72,C73,C74,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C86,C9,D10,D11,D3,D5,D6,D8
`Chr3:64544075`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	82	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A21,A24,A25,A3,A8,B100,B101,B108,B111,B114,B130,B134,B136,B137,B15,B16,B17,B2,B21,B34,B35,B42,B43,B44,B48,B52,B54,B56,B61,B63,B65,B68,B73,B75,B77,B85,B86,B9,B96,B99,C12,C14,C17,C20,C21,C23,C24,C28,C3,C32,C34,C35,C37,C39,C40,C41,C46,C47,C50,C51,C52,C54,C58,C60,C61,C68,C74,C78,C79,C8,C81,C84,C86,D10,D11,D8
`Chr3:64544199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B22,B90,B92
`Chr3:64544297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C13,C80
`Chr3:64544457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr3:64545811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:64545821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800010.1

651 aa

326

651

Neurochondrin

PF05536 Neurochondrin 22-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800010.1`	Pfam	`PF05536`	Neurochondrin	Repeat	22	557	1.9e-114	384.0	Neurochondrin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944027.1
ATTAACCAGAATCAAAACTCAAGTCTTTCCGCCTCTCTCTCTTTCTCTCCTCTCTGCAACTTTGAGAAGACGTCGCGGACTCGCGCCTAATTTAGCTGCGGCTTGTGATGATGGAGCAACAATGTTCCACTTCTGCTCTACAAGTATCGCCGTCTCCGACTCCTTCTCCTTCGCCGTCACTGGAAGATGTGATGAGACTATTGAAAGGAAGCACCGATTCTCAACGGCTAGCTGGCCTTCTTCTGGTCACCAAATTCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015592
ATGATGGAGCAACAATGTTCCACTTCTGCTCTACAAGTATCGCCGTCTCCGACTCCTTCTCCTTCGCCGTCACTGGAAGATGTGATGAGACTATTGAAAGGAAGCACCGATTCTCAACGGCTAGCTGGCCTTCTTCTGGTCACCAAATTCTGCGACAAAAACGATAAACCTACTATCCTCAGCGTCTACAACGCCGTCGGTTCCACTTTCCTCCACCGCCTCTTGCTCACCGGATTGGGGAAAGGAGGCGGCGGAGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800010.1
MMEQQCSTSALQVSPSPTPSPSPSLEDVMRLLKGSTDSQRLAGLLLVTKFCDKNDKPTILSVYNAVGSTFLHRLLLTGLGKGGGGANIDNADRHAYLKLSVTILAAFARVPELAATHEMLSKIPLVLDLLPNQSNLSLTEQCFEFLFLVTTAQEDGAITFYRSGGMNVLASQMPALPDGSHVMELAMKLVQFIISKLPAENVYLEHSAELSKLVSAIAKQFARLHNALKFEALHLLSALLSSSYSGVLCSALQSLSSDDW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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