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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004745`

染色体: Chr03 坐标: 64553849-64557146 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004745`
名称	SmilChr03G004745
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 55 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64553849 - 64557146 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015591`
GeneID	`131015591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015591`
原始查询	`SmilChr03G004745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 55 homolog
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 55 homolog
Arabidopsis	`AT1G32410` (AT1G32410) Vacuolar protein sorting 55 (VPS55) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840134] identity=67.4; qcov=1; evalue=4.63e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0803400` (P0689B12.28-1) - identity=73.6; qcov=0.935; evalue=1.63e-65; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0032511 (late endosome to vacuole transport via multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF04133 (Vps55)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057800007.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057800007.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057800007.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057800007.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64554061`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr3:64554061`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr3:64555742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:64555763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B46
`Chr3:64555799`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,B46
`Chr3:64555799`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800007.1

138 aa

138

Vps55

PF04133 Vps55 18-131 aa

XP_057800008.1

138 aa

138

Vps55

PF04133 Vps55 18-131 aa

XP_057800009.1

138 aa

138

Vps55

PF04133 Vps55 18-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800007.1`	Pfam	`PF04133`	Vps55	Family	18	131	2.2e-35	121.8	Vacuolar protein sorting 55
`XP_057800008.1`	Pfam	`PF04133`	Vps55	Family	18	131	2.2e-35	121.8	Vacuolar protein sorting 55
`XP_057800009.1`	Pfam	`PF04133`	Vps55	Family	18	131	2.2e-35	121.8	Vacuolar protein sorting 55

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944025.1
ATCCTAACCAAATGAAAATTGATGTATTCGCAACGGCGCTACGGTAGTTAGTAAAGAAATTAGTTCCCTACTACTCCAATAATTATTATACCGCGAGAATCCTTGAGTTACGCAATTACCCAACCCTCGAATCTCTCTCTCTCTCCCAAATCCATTCTAAATACCTGTTGCTACTGTGTTTCTTTGCTTAGTTGCAATTCCGTATTTGTTCTGATTACTCATACGCGATCATTCACATCGCCATGAATCCAATCCTCTGC...

XM_057944024.1
ATCCTAACCAAATGAAAATTGATGTATTCGCAACGGCGCTACGGTAGTTAGTAAAGAAATTAGTTCCCTACTACTCCAATAATTATTATACCGCGAGAATCCTTGAGTTACGCAATTACCCAACCCTCGAATCTCTCTCTCTCTCCCAAATCCATTCTAAATACCTGTTGCTACTGTGTTTCTTTGCTTAGTTGCAATTCCGTATTTGTTCTGATTACTCATACGCGATCATTCACATCGCCATGAATCCAATCCTCTGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015591
ATGGCAGACTTGCCTTATCACATAAGATCTTGCTTGCATACTGGGAAACTTGCCTTGCTAGCGATTCTTGTCTCGGGGGGGATTGTACTGCAAATACTGGCTTGTGCTTTATACAATAATTGGTGGCCAATGTTGACAGTTTTAATGTATGTACTTTTACCGATGCCTTTACTCTTCTTTGCTGGATCCAACGCCTCTTCCCTTTATTCTGAATCAAGTAGTGGTTGGATAGATGCTACTAAGTTTCTGACTGGTGCTTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800007.1
MADLPYHIRSCLHTGKLALLAILVSGGIVLQILACALYNNWWPMLTVLMYVLLPMPLLFFAGSNASSLYSESSSGWIDATKFLTGASVVGSIAIPVILKHAGVICWGALAMELSSFFIFGMAILCFIGTNDDDAYSMF

XP_057800008.1
MADLPYHIRSCLHTGKLALLAILVSGGIVLQILACALYNNWWPMLTVLMYVLLPMPLLFFAGSNASSLYSESSSGWIDATKFLTGASVVGSIAIPVILKHAGVICWGALAMELSSFFIFGMAILCFIGTNDDDAYSMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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