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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004750`

染色体: Chr03 坐标: 64586076-64593760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004750`
名称	SmilChr03G004750
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64586076 - 64593760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019177`
GeneID	`131019177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019177`
原始查询	`SmilChr03G004750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
产物	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C-like
Arabidopsis	`AT4G31880` (AT4G31880) transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829318] identity=62.9; qcov=0.255; evalue=9.78e-102; confidence=weak
Rice	`Os04g0501600` (BIP106) - identity=48.8; qcov=0.261; evalue=3.05e-65; confidence=weak
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion)
KEGG	-
Pfam	PF20168 (PDS5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803846.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803846.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803846.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803846.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64586667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:64586796`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A4,B107,B115,B130,B138,B23,B35,B54,B8,B83,B87,C11,C53,C59,C69,C83,C87,D11,D9
`Chr3:64586805`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B130,B35,B8,C53,C83
`Chr3:64586805`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B130,B35,B8,C53,C83
`Chr3:64587600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B69
`Chr3:64587778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B122,B129,B45,B76
`Chr3:64588745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B127,B140,B29,B54,D11
`Chr3:64588745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B140,B29,B54,D11
`Chr3:64588757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:64588864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B114,B13,B65,B69
`Chr3:64588865`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B114,B65,B69
`Chr3:64588865`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B114,B65,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803846.1

972 aa

486

972

PDS5

PF20168 PDS5 28-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803846.1`	Pfam	`PF20168`	PDS5	Repeat	28	234	2.3e-57	195.3	Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947863.1
GTTGGATATTGCTCTGGATTCGCAAATCGGGGGTGCGCTGCTGCACCTAAATAAAAAACAAGCGGTAATTTCTGTCTCTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCACCGGATTCTGCTTTACTTCCCAATCCCAATTCCTGCTCTATTCTAGGGTTTCCGAGAATTGCAATTTCAAAATTCCCAACGGGACACTAGTTGTTCCTAATATTCAAACCAAATACAATTGTCCTTCGTATTCTTGGGCCTAGGGTTTCCTGGGCATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019177
ATGCCTACACTTTCCGACAAAGAACTGGAAGAGCGGCTTACCGCAGCTGGGAAAAGTCTTGCTCAGCCTCCTTCGTCGCTCGATGAACTCCTCCCGCTTCTCGATCGAGTTGAGGAACTTCTATCAAAAGTGGAGCAGTCTCCTCCCAAAACAATGCAAAATGCACTTACTCCACTGATGAAGGCTCTTGTCATGGAGGTGCTCTTAGAGCATTCTGATATTGACGTAAAAGTAGGTGTAGCTTCTTGCATCAGTGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803846.1
MPTLSDKELEERLTAAGKSLAQPPSSLDELLPLLDRVEELLSKVEQSPPKTMQNALTPLMKALVMEVLLEHSDIDVKVGVASCISEITRITAPDAPYDDDKMKDVFQLIVSSFENLSDVSSRSHEKRVTILETVAKVRSCVIMLDLECDQMIVDMFQHFLKAIRANHSEMIFTSMETIMTLVIEESEDISPDLLAPILATLRRNNQEVTPIARKLAERVIQNAADKLRPCLRQAVTSLETSFDEYSEVVASVFVSIIVLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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