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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000018`

染色体: Chr04 坐标: 230317-231050 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000018`
名称	SmilChr04G000018
描述	ethylene-responsive transcription factor 13-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	230317 - 231050 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022829`
GeneID	`131022829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022829`
原始查询	`SmilChr04G000018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor 13-like
产物	ethylene-responsive transcription factor 13-like
Arabidopsis	`AT2G44840` (ERF13) ethylene-responsive element binding factor 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819093] identity=54.5; qcov=0.729; evalue=2.86e-40; confidence=medium
Rice	`Os02g0654700` (ERF91) - identity=62.5; qcov=0.442; evalue=9.85e-30; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009873 (ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808339.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808339.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808339.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808339.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:230426`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A16,A18,A24,B108,B111,B129,B132,B136,B21,B26,B28,B29,B35,B5,B52,B63,B76,B84,B9,B90,B91,B98,B99,C11,C13,C15,C17,C18,C21,C22,C26,C29,C33,C34,C35,C41,C42,C46,C49,C50,C51,C61,C69,C73,C85,C87,D5,D9
`Chr4:230441`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	77	A10,A16,A18,A24,B1,B104,B108,B111,B112,B113,B119,B12,B122,B129,B132,B136,B138,B139,B140,B21,B26,B28,B29,B3,B35,B45,B5,B52,B53,B55,B63,B69,B76,B84,B9,B90,B91,B93,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C17,C18,C2,C21,C22,C24,C26,C27,C29,C33,C34,C35,C41,C42,C46,C49,C50,C51,C55,C60,C61,C63,C69,C73,C77,C85,C87,D4,D5,D8,D9
`Chr4:230480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B60,C45
`Chr4:230628`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,A7,B132,B14,B8,B84,C25,C34,D10,D8
`Chr4:230656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:230733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr4:230760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr4:230838`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B131,B139,B26,B70,B88,C38,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808339.1

181 aa

181

AP2

PF00847 AP2 75-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808339.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	75	126	9.3e-15	55.4	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952356.1
CGCTAAGAACTAGAAGCCATACTTAGCATAATATTATTTGAGAAGTAAATATTTTGTCCTTTATTAATCACATTATTCCTTCATATTTACGTAGAAAAGAAAAAAAAAATTAATGGAAGCACAAAACGTATCTGAATTCGATCTGGCTAGGCTCGACTCCATACAATGCTTTCTTCTCAGCGATTTCGACTTCGATTTCAATTTTGATTTCGATTTCGATTCATCACCGACAAATCCTCCGCTGATCAATGCGACGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022829
ATGGAAGCACAAAACGTATCTGAATTCGATCTGGCTAGGCTCGACTCCATACAATGCTTTCTTCTCAGCGATTTCGACTTCGATTTCAATTTTGATTTCGATTTCGATTCATCACCGACAAATCCTCCGCTGATCAATGCGACGCCGATCAACGACGAGAGTCATGATTCCGCAGGGTCGGAGGAGAAGCCGCAGAGCATTGCGGCGGTGACGGAGTGGAAGCGGTACAGAGGCGTGAGGCGGCGGCCGTGGGGGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808339.1
MEAQNVSEFDLARLDSIQCFLLSDFDFDFNFDFDFDSSPTNPPLINATPINDESHDSAGSEEKPQSIAAVTEWKRYRGVRRRPWGKFAAEIRNPVKKGARLWLGTYETPEEAAVAYDRAAFKLRGSRARVNFPHLIGSGVSEPTRVMKRRRTRSSQYQSESYSESLKHATKKMKIVVASLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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