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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000023`

染色体: Chr04 坐标: 258943-263908 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000023`
名称	SmilChr04G000023
描述	plasma membrane ATPase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	258943 - 263908 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022834`
GeneID	`131022834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022834`
原始查询	`SmilChr04G000023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasma membrane ATPase 1-like
产物	plasma membrane ATPase 1-like
Arabidopsis	`AT3G60330` (HA7) H[+]-ATPase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825204] identity=79.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0638700` (OSA3) - identity=80; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008553 (P-type proton-exporting transporter activity); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051453 (regulation of intracellular pH); GO:0120029 (proton export across plasma membrane)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00122 (E1-E2_ATPase); PF00690 (Cation_ATPase_N); PF00702 (Hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808349.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808349.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057808349.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808349.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:259378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:259415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:259936`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr4:259936`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr4:259945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B39
`Chr4:259945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr4:259970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B77
`Chr4:260047`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B33,B70,C34,C41,C57
`Chr4:260047`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B33,B70,C34,C41,C57
`Chr4:260170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr4:260234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B45,C6,C7,D10
`Chr4:260905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808349.1

961 aa

480

961

Cation_ATPase_N

E1-E2_ATPase

Hydrolase

PF00690 Cation_ATPase_N 19-82 aa PF00122 E1-E2_ATPase 131-231 aa PF00702 Hydrolase 326-603 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808349.1`	Pfam	`PF00690`	Cation_ATPase_N	Domain	19	82	6.8e-14	52.0	Cation transporter/ATPase, N-terminus
`XP_057808349.1`	Pfam	`PF00122`	E1-E2_ATPase	Domain	131	231	4.3e-33	113.9	P-type ATPase actuator domain
`XP_057808349.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	326	603	1.6e-13	52.2	haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952366.1
CCTATACCTGCACACACACACACACACACACACACGTGTATATATACACATTACTTCTCCATTCTTGGAACACTCTGTCCATGGCTAACATCTCCACAATCCAATGAACTGCATGTTGACAAGTTCTTGAATTGAGGAGGTGCAACTCTCAACTCTCAACTTCATGCTTAAGATTTTGAACCATTTCTCCTTTTTGTGAGTTTTGAGAGTGAAGCAAGATTTTGCAAGTGAAAATGGACAAGTCCATAGCACTAGGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022834
ATGGACAAGTCCATAGCACTAGGTCCTGTTATTAGGGAAGAGGTTAATCTGGAGAGTATACCCATCGAAGAAGTCTTCAAATGCCTCAAATGCACGCCACAAGGGTTGAGCAGCAACCAAGCTGAAGAAAGACTGGATGTATTTGGATACAACAAACTCGAAGAGAAAAATGAAAGCAAAGTTGTCAAGTTTCTTGGGTTTATGTGGAACCCTTTATCTTGGGTGATGGAAGCAGCAGCTATAATGGCCATTGCTCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808349.1
MDKSIALGPVIREEVNLESIPIEEVFKCLKCTPQGLSSNQAEERLDVFGYNKLEEKNESKVVKFLGFMWNPLSWVMEAAAIMAIALAHGGNKPSDYPDFIGIIVLLIINSTISFIEENNAGNAAAALMARLAPKAKVLRDGKWSEEEAAILVPGDIISIKLGDIIPADARLLEGDPLKIDQSALTGESLPVTKNPGDGVYSGSTCKQGEIEGVVIATGVHTFFGKAAHLVENTNHVGHFQKVLTSIGNFCICSIAVGMLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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