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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000027`

染色体: Chr04 坐标: 275700-279476 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000027`
名称	SmilChr04G000027
描述	probable WRKY transcription factor 12
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	275700 - 279476 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022839`
GeneID	`131022839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022839`
原始查询	`SmilChr04G000027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 12
产物	probable WRKY transcription factor 12
Arabidopsis	`AT2G44745` (WRKY12) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819083] identity=58.7; qcov=1.06; evalue=3.63e-71; confidence=high
Rice	`Os04g0545000` (OsWRKY36) - identity=82.9; qcov=0.498; evalue=4.49e-60; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808357.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808357.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808357.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808357.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:276218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:276744`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B97,C77
`Chr4:276744`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B97,C77
`Chr4:276830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,C83
`Chr4:276847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808357.1

213 aa

106

213

WRKY

PF03106 WRKY 142-198 aa

XP_057808358.1

212 aa

106

212

WRKY

PF03106 WRKY 142-197 aa

XP_057808359.1

211 aa

106

211

WRKY

PF03106 WRKY 140-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808357.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	142	198	8.1e-26	90.7	WRKY DNA -binding domain
`XP_057808358.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	142	197	1.4e-22	80.3	WRKY DNA -binding domain
`XP_057808359.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	140	196	8e-26	90.7	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952374.1
GAGAAGGGTGTGAGGCAGTGCTTCTTTATTTGTAGAATCCGGACAACCTAAGTAGAAGAAACACGATCATGTATAATCTTGAAATTTCATGCCACAATATTCCATATCCAGCGTTTACTAGTTGACCCAACAATACTCAAATTATTATTTATATACTGTTATAAAAAATTAAAATTCAAGAAACATAAATATAGAGAGTCGCCCAGCCCCCACACATATTTGCAGAGAGAAAAATTTTGAATTGATCATCAACTATTAGT...

XM_057952375.1
TGTAGAATCCGGACAACCTAAGTAGAAGAAACACGATCATGTATAATCTTGAAATTTCATGCCACAATATTCCATATCCAGCGTTTACTAGTTGACCCAACAATACTCAAATTATTATTTATATACTGTTATAAAAAATTAAAATTCAAGAAACATAAATATAGAGAGTCGCCCAGCCCCCACACATATTTGCAGAGAGAAAAATTTTGAATTGATCATCAACTATTAGTTTAGAGAAAATGGAAGGGGAAAGAGGGTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022839
ATGGAAGGGGAAAGAGGGTTGGCTCCCATTTATGATCATCATCTGCAGATTTCCTTCAGCGCTCCTCCTCATCATCAAGAGCAAGAAATGGGGTTTGTGCAGTTCGAAGATCATAATCCGGTGTTGAGCTTTCTGGTGGCGCCGCCGCAGATGGCCGCCAAGGCAACCACCGCCACCAATAATAATTGTTCCTTAGGGTTCAATCATGCTGAGCTTGCAGTGAATAGACCCTCATGGAATAACGACCAGGTAGAGGTGGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057808357.1
MEGERGLAPIYDHHLQISFSAPPHHQEQEMGFVQFEDHNPVLSFLVAPPQMAAKATTATNNNCSLGFNHAELAVNRPSWNNDQVEVVDPKVVNDENCSGNANDGGNSWWRSCSSDKNKVKIRRKLREPRFCFQTRSDVDVLDDGYKWRKYGQKVVKNSLHPRSYYRCTHNNCRVKKRVERLSEDCRMVITTYEGRHNHSPSDDSNSSDCYNSF

XP_057808358.1
MEGERGLAPIYDHHLQISFSAPPHHQEQEMGFVQFEDHNPVLSFLVAPPQMAAKATTATNNNCSLGFNHAELAVNRPSWNNDQVEVVDPKVVNDENCSGNANDGGNSWWRSCSSDKNKVKIRRKLREPRFCFQTRSDVDVLDDGYKWRKYGQKVVKNSLHPSYYRCTHNNCRVKKRVERLSEDCRMVITTYEGRHNHSPSDDSNSSDCYNSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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