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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr04G000033

染色体: Chr04 坐标: 322802-331066 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr04G000033
名称SmilChr04G000033
描述exocyst complex component SEC6-like
染色体 / SeqIDChr04 / NC_080390.1
坐标与链方向322802 - 331066 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131022846
GeneID131022846
locus_tag-
NCBI NameLOC131022846
原始查询SmilChr04G000033

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述exocyst complex component SEC6-like
产物exocyst complex component SEC6-like
ArabidopsisAT1G71820 (SEC6)
SEC6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843512]
identity=75.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
RiceOs02g0749500
-
identity=88.9; qcov=0.096; evalue=4.74e-17; confidence=weak
GOGO:0000145 (exocyst); GO:0000149 (SNARE binding); GO:0006887 (exocytosis); GO:0051601 (exocyst localization)
KEGG-
PfamPF06046 (Sec6)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131022846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057808372.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057808372.1
3 Phragmoplast Phragmoplast 0.60000 XP_057808374.1
4 Endocytic vesicle Endocytic vesicle 0.40000 XP_057808372.1
5 Golgi apparatus 高尔基体 0.40000 XP_057808374.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr4:325846 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B22,C6
Chr4:326701 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B132,B5,B64,C53,C55
Chr4:327156 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B33
Chr4:327667 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C80
Chr4:327683 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B111
Chr4:327713 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B58
Chr4:329896 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808372.1
736 aa
N
1
368
736
Sec6
C
PF06046 Sec6 176-687 aa
XP_057808373.1
697 aa
N
1
348
697
Sec6
C
PF06046 Sec6 176-661 aa
XP_057808374.1
562 aa
N
1
281
562
Sec6
C
PF06046 Sec6 176-557 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057808372.1 Pfam PF06046 Sec6 Repeat 176 687 3.4e-116 389.7 Exocyst complex component Sec6
XP_057808373.1 Pfam PF06046 Sec6 Repeat 176 661 1.3e-103 348.1 Exocyst complex component Sec6
XP_057808374.1 Pfam PF06046 Sec6 Repeat 176 557 8.5e-82 276.1 Exocyst complex component Sec6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XR_009101437.1
TTAGTAGTTTGACCGTTATAACCGTGGGCTAAGAGAAACAATTTTGGAGCTGTATTCGATCACTCTCTTCGTGTGCTCTCTCTCTCTCTCATATACACACACATACGCGATTGAGATATTGTGGAATTTCATGGACATTTGCTACAATGGTGGTGGTGAATTGGCAGAATTTTCTATCCGAGTGAGTCGAGATCGAAATAGAGAAGGATAACAAGATGATGGCCGAGGATTTGGGGGTGGAGGCGAAGGAGGCATCTGTG...
XR_009101436.1
AGTAGTTTGACCGTTATAACCGTGGGCTAAGAGAAACAATTTTGGAGCTGTATTCGATCACTCTCTTCGTGTGCTCTCTCTCTCTCTCATATACACACACATACGCGATTGAGATATTGTGGAATTTCATGGACATTTGCTACAATGGTGGTGGTGAATTGGCAGAATTTTCTATCCGAGTGAGTCGAGATCGAAATAGAGAAGGATAACAAGATGATGGCCGAGGATTTGGGGGTGGAGGCGAAGGAGGCATCTGTGAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
LOC131022846
ATGATGGCCGAGGATTTGGGGGTGGAGGCGAAGGAGGCATCTGTGAGAGAGGTGGCGAAGCTTCTGCCGCTGCCGGAGCTCTTGCAGTCCATCGCTTCGATTAAAGCTGATTACATTGCCCGTCAACAGGCGAATGATGCACAACTCAGTACAATGGTTGCTGAACAGGTTGAGCAGGCACAAGCGGGTCTAAAATCACTGAACTGGTCCCAAAAGACGATAAATCATCTCAGAGAAAATTTCTCTAATATTGAAAAATT...
LOC131022846
ATGATGGCCGAGGATTTGGGGGTGGAGGCGAAGGAGGCATCTGTGAGAGAGGTGGCGAAGCTTCTGCCGCTGCCGGAGCTCTTGCAGTCCATCGCTTCGATTAAAGCTGATTACATTGCCCGTCAACAGGCGAATGATGCACAACTCAGTACAATGGTTGCTGAACAGGTTGAGCAGGCACAAGCGGGTCTAAAATCACTGAACTGGTCCCAAAAGACGATAAATCATCTCAGAGAAAATTTCTCTAATATTGAAAAATT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057808372.1
MMAEDLGVEAKEASVREVAKLLPLPELLQSIASIKADYIARQQANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLKSLNWSQKTINHLRENFSNIEKLCLQCQTLIENHDQIKILSNVRNNLNTTLKDVEGMMSISTEAAAARSSLNDNKELINTYERLTKLDGKRRFALAAVSSHEEEVGRLREYFEDIDRTWETFEKTLWGHISNFINLSKECPKTLVRALRVVEMQEILDLQLATEAAEAEGDGEMELQRNTKNTKGKGYKDKCYEEV...
XP_057808373.1
MMAEDLGVEAKEASVREVAKLLPLPELLQSIASIKADYIARQQANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLKSLNWSQKTINHLRENFSNIEKLCLQCQTLIENHDQIKILSNVRNNLNTTLKDVEGMMSISTEAAAARSSLNDNKELINTYERLTKLDGKRRFALAAVSSHEEEVGRLREYFEDIDRTWETFEKTLWGHISNFINLSKECPKTLVRALRVVEMQEILDLQLATEAAEAEGDGEMELQRNTKNTKGKGYKDKCYEEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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