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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000035`

染色体: Chr04 坐标: 332948-334972 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000035`
名称	SmilChr04G000035
描述	uncharacterized SmilChr04G000035
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	332948 - 334972 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022847`
GeneID	`131022847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022847`
原始查询	`SmilChr04G000035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209]; symbol=AT3G60380; hit=AT3G60380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209]; symbol=AT3G60380; hit=AT3G60380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G60380` (AT3G60380) cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825209] identity=42.2; qcov=0.335; evalue=2.01e-24; confidence=low
Rice	`Os10g0562000` (OSJNBb0089A17.6) - identity=27.2; qcov=0.5; evalue=3.59e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808375.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808375.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057808375.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808375.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:333467`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr4:333467`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr4:333470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:333503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B95,C65
`Chr4:333874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:333929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr4:334011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:334321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:334475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:334635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B30,B77
`Chr4:334741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808375.1

558 aa

279

558

DUF761

PF05553 DUF761 528-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808375.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	528	555	1.1e-08	35.1	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952392.1
TCAAATAATTGAAGAGGGGCAATTCCGCCAATCCACATCAACGGTCATAATTGCTTCAGCTTCACCCACTCCCTTTTCTCCCTTCGCAGCTTTGCTAATAAGTCTCCCTTGTTTGGCCTTCACCCAATCTGCATTCAACAATGGCAGCGGCAAACGCAGCGGCGGCCCCCAATTACTCTCCATTCACACTTCCACCACAGCCCTCAATCACTCGGAAAATCCCAAGTAAGTCGGATTCAAACGCCCTCTGCAAAACCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022847
ATGGCAGCGGCAAACGCAGCGGCGGCCCCCAATTACTCTCCATTCACACTTCCACCACAGCCCTCAATCACTCGGAAAATCCCAAGTAAGTCGGATTCAAACGCCCTCTGCAAAACCCTCATAATTGTCCTTCTCCTTCTCGCCATTCCACTATTTCCTTCACAAGCGCCGGACTTCATCACCCAAACCGTCTTCACCGATTTCTGGGAGATTATCCACCTCCTCTTCATCGGAATCGCCGTCTCCTACGGCCTCTTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808375.1
MAAANAAAAPNYSPFTLPPQPSITRKIPSKSDSNALCKTLIIVLLLLAIPLFPSQAPDFITQTVFTDFWEIIHLLFIGIAVSYGLLSRRTAQFVPDKSADSSLSGISHLTSIFDDGYENVCYEHDMLHNYVNCGDRFVGNDECVVPSGAKIRSFVPNAENEGDGNGNRAWRSCYSKGESLVVVSNAKCFQGGSSDFKPLNLPIRSLRSRARDNDSDKQEFKKGNEFSSNKYEGKGNDDDDDASVVKIRGVVPVNLDKKFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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