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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000038`

染色体: Chr04 坐标: 361522-363400 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000038`
名称	SmilChr04G000038
描述	uncharacterized SmilChr04G000038
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	361522 - 363400 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022852`
GeneID	`131022852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022852`
原始查询	`SmilChr04G000038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G60410` (AT3G60410) - identity=44.3; qcov=0.331; evalue=7.81e-26; confidence=low
Rice	`Os05g0551500` (OsEnS-78) - identity=34.8; qcov=0.193; evalue=2.24e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07797 (DUF1639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808379.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808379.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808379.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808379.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808379.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:361772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C52
`Chr4:361787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B7,B85,D10
`Chr4:361798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C78
`Chr4:361963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C59,C8
`Chr4:361991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr4:361994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B12,B98,C82
`Chr4:362062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:362066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B19,B95,C65
`Chr4:362191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C13,C60
`Chr4:362270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:362402`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A18,A23,A7,B100,B109,B117,B12,B120,B124,B130,B136,B137,B139,B2,B24,B27,B33,B34,B40,B41,B49,B5,B57,B58,B62,B67,B70,B74,B79,B83,B97,C23,C28,C32,C4,C48,C53,C55,C56,C59,C61,C62,C68,C76,C77,C84
`Chr4:362403`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A18,A23,A7,B100,B109,B117,B12,B120,B124,B130,B136,B137,B139,B2,B24,B27,B33,B34,B40,B41,B49,B5,B57,B58,B62,B67,B70,B74,B79,B83,B97,C23,C28,C32,C4,C48,C53,C55,C56,C59,C61,C62,C68,C76,C77,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808379.1

477 aa

238

477

DUF1639

PF07797 DUF1639 419-468 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808379.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	419	468	7.1e-28	97.1	Protein of unknown function (DUF1639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952396.1
ACCTACATACATTGCATCTAGAATGATGAAACTCTGAGTTATTTAGGGTTTAATTAATTTCGCATGTAACTGTAAATTGTGTGTGATAATTGATTAAAAATCCATGGCGTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCATGCTCCAGCCAAGTCGTCTCAGCCGCTGCACAATTTCGAGCTGCCGCCGCTGCTCAAATGGAACAGTAAAGACGGGACCCACAAGCGCCACCGCTCCATGAAGCATGCCGTCACCGTCGCCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022852
ATGGCGTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCATGCTCCAGCCAAGTCGTCTCAGCCGCTGCACAATTTCGAGCTGCCGCCGCTGCTCAAATGGAACAGTAAAGACGGGACCCACAAGCGCCACCGCTCCATGAAGCATGCCGTCACCGTCGCCGTCGCCTCCCCCATGCCGCCGCCGCCGCAGGAGCCGCCGCCGGTGGTTGACGAGAGGCTGTCGCTGCTCCGGGAGGAGGCTCTGCGGCCCTTCCGCGGCCGCGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808379.1
MASSSSSSSSHAPAKSSQPLHNFELPPLLKWNSKDGTHKRHRSMKHAVTVAVASPMPPPPQEPPPVVDERLSLLREEALRPFRGRDWWERSDVIAYRRNPLKKSSSSPAPASADSGFKISDAADRNPSKKDYDVYRRNPLKKSAFAAASPPSFFDSGEGQTSAAHHRNPPLLEKSAFASPDALNPKNPLLKKPAFAPSPKRHTFSQDHKPNLHKKAEADNPSNPKTPLLKKSAFTLSSNSEDKKKSSNPTEDKSKKSSKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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