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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000045`

染色体: Chr04 坐标: 419699-421542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000045`
名称	SmilChr04G000045
描述	type III polyketide synthase A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	419699 - 421542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022861`
GeneID	`131022861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022861`
原始查询	`SmilChr04G000045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	type III polyketide synthase A-like
产物	type III polyketide synthase A-like
Arabidopsis	`AT1G02050` (LAP6) Chalcone and stilbene synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839280] identity=74.7; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0411300` (OsPKS2) - identity=62.9; qcov=1.01; evalue=1.42e-171; confidence=high
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups); GO:0030639 (polyketide biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00195 (Chal_sti_synt_N); PF02797 (Chal_sti_synt_C); PF08545 (ACP_syn_III)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057808393.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057808393.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808393.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808393.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:420029`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr4:420029`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr4:420030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:420061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B117,B120,B127
`Chr4:420154`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,B77
`Chr4:420154`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B110,B77
`Chr4:420312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B46,B94
`Chr4:420372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B44,B48,B98
`Chr4:420375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B54,B77,C72
`Chr4:420554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B59,B66,D4
`Chr4:420807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr4:420831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808393.1

386 aa

193

386

Chal_sti_synt_N

ACP_syn_III

Chal_sti_synt_C

PF00195 Chal_sti_synt_N 5-224 aa PF08545 ACP_syn_III 159-227 aa PF02797 Chal_sti_synt_C 234-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808393.1`	Pfam	`PF00195`	Chal_sti_synt_N	Domain	5	224	8.5e-103	343.4	Chalcone and stilbene synthases, N-terminal domain
`XP_057808393.1`	Pfam	`PF08545`	ACP_syn_III	Domain	159	227	8.1e-07	29.6	3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III
`XP_057808393.1`	Pfam	`PF02797`	Chal_sti_synt_C	Domain	234	384	5.5e-63	212.2	Chalcone and stilbene synthases, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952410.1
GAAAAATCAGCATTGCATATGCATGCCTACTTTTTTAAGGCAAACACAATTTATATTAACTACATGCAGATGGTAAAGGAAAGAGAAAGATTATTGCAATCTAATAAGTGATTCACACATTCAACACAAAGAAAATTAAAGATTGTTTAATGTGTCATGCTGGTGTTGTTGAACACCAACAAGCCTCCAAGAAAATGCTCATCTCCCCATTTATATTGAGCCCTATGTGTCTGCATCTGTATCTCCCAGCAAATAGTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022861
ATGTCGACAAAGCAGCAGCGCAGCCCCACCGCCGGCAAGGCGACGATCCTCGGCATCGGCAAGGCCTTCCCCCGCCAGCTGGTGCTTCAAGATCTCCTCGTCGAGGGCTACATCCGCGACACCAACTGCGATGACCTCGCCATCAAGGACAAACTCCAACGCCTCTGCAAAACGACGACGGTGAAAACGAGGTACACGGTGATGTCGAAGGAGATACTGGAGGAGTATCCGGAGCTGGCGACGGAGGGGTCGCCGACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808393.1
MSTKQQRSPTAGKATILGIGKAFPRQLVLQDLLVEGYIRDTNCDDLAIKDKLQRLCKTTTVKTRYTVMSKEILEEYPELATEGSPTIKQRLDIAHPAVLEMAKEASLACLKDWKREAKDITHVVYVSSSEIRLPGGDLYLATELALRNDVARVMLYFLGCYGGVTGLRVAKDIAENNPGSRVLLATSETTILGFRPPNKSRPYDLVGAALFGDGAAAVVVGADPVPGVETAFMELNTAAQQFLPGTSHVIDGRLSEEGIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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