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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000051`

染色体: Chr04 坐标: 453845-458680 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000051`
名称	SmilChr04G000051
描述	carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	453845 - 458680 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021096`
GeneID	`131021096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021096`
原始查询	`SmilChr04G000051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic-like
产物	carotenoid cleavage dioxygenase 7%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G44990` (CCD7) carotenoid cleavage dioxygenase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819107] identity=60.6; qcov=0.911; evalue=1.14e-126; confidence=high
Rice	`Os04g0550600` (HTD1) - identity=54.6; qcov=0.902; evalue=9.62e-115; confidence=high
GO	GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0016121 (carotene catabolic process); GO:0045549 (9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase activity)
KEGG	smil00906 (Carotenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03055 (RPE65)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057806169.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057806169.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806169.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806169.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:455407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr4:457272`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr4:457272`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr4:457443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B78,C20,C6
`Chr4:457575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr4:457575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:457636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:457642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B66,B71,C62
`Chr4:457809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C34,C67,D6
`Chr4:457857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:457890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:457893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806169.1

315 aa

158

315

RPE65

PF03055 RPE65 23-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806169.1`	Pfam	`PF03055`	RPE65	Repeat	23	288	4.7e-45	155.2	Retinal pigment epithelial membrane protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950186.1
ATGAAAGTTGACTTATTTGGAAACAGAATCAAGTTAGACGTTGCAGGTTCAATGACAGCATTATGTGGATTTTCTCCGATGATATCAGCGTTGTCGGTAAACCCAAGTAAGACCACGTGTCCAATTTATGTGCTTCCAAGATTTGAAGACTCGAAAACGAAATCAAGGGATTGGAGAGTCCCAATTGAAGCACCTTCACAGATGTGGGTGCTTCACGTTGGGAATGCTTTCGAGGAGAAATATGTGAATGGAGTTCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021096
ATGAAAGTTGACTTATTTGGAAACAGAATCAAGTTAGACGTTGCAGGTTCAATGACAGCATTATGTGGATTTTCTCCGATGATATCAGCGTTGTCGGTAAACCCAAGTAAGACCACGTGTCCAATTTATGTGCTTCCAAGATTTGAAGACTCGAAAACGAAATCAAGGGATTGGAGAGTCCCAATTGAAGCACCTTCACAGATGTGGGTGCTTCACGTTGGGAATGCTTTCGAGGAGAAATATGTGAATGGAGTTCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806169.1
MKVDLFGNRIKLDVAGSMTALCGFSPMISALSVNPSKTTCPIYVLPRFEDSKTKSRDWRVPIEAPSQMWVLHVGNAFEEKYVNGVLHIQIQASTCSYQWFNFQKMFGYDWQSGKLDPSMMNLKQGQETLLPQLVKVSIKLDVDGNCQDCSVDRLSEWSKPSDFPVINQEYSGARNMYIYAATSSGSRRALPHFPFDTVVKMNTATKATHTWSTSRRRFIGEPVFIPKAEAQAEDDGFLLVVEYAVSTQRCYFVILDAKLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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