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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000053`

染色体: Chr04 坐标: 467964-474356 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000053`
名称	SmilChr04G000053
描述	nuclear pore complex protein NUP62-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	467964 - 474356 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021174`
GeneID	`131021174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021174`
原始查询	`SmilChr04G000053`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP62-like
产物	nuclear pore complex protein NUP62-like
Arabidopsis	`AT2G45000` (EMB2766) structural constituent of nuclear pore [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819108] identity=67.7; qcov=0.408; evalue=3.12e-134; confidence=low
Rice	`Os01g0856600` - identity=58.8; qcov=0.144; evalue=6.07e-42; confidence=weak
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006405 (RNA export from nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0044613 (nuclear pore central transport channel)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05064 (Nsp1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806247.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057806247.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057806247.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806247.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:468270`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr4:468270`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr4:468274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B85,B9,C41,C42
`Chr4:468279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B85,B9,C41,C42
`Chr4:468369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C42,C52
`Chr4:468671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B7
`Chr4:468770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:468828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A15,A5,B26
`Chr4:469065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B66
`Chr4:469184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B33,B41,C57
`Chr4:469389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B125
`Chr4:469421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B49,B89,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806247.1

790 aa

395

790

Nsp1_C

PF05064 Nsp1_C 584-683 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806247.1`	Pfam	`PF05064`	Nsp1_C	Family	584	683	4.2e-22	78.8	Nsp1-like C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950264.1
TCAAAATAGGCCCATCCCAAACCCTTCTCTCATTTTTCTTCACTCAAGCTGCCACAAACCGCTCACTGCTCTCTGTCGTCTCCAACTCGCACTGTTTATGAGTAATATTGTTGTTGAAATCACATCTAGAATTTTGAAATTGTTGTTGAAATCGCGTTTAGTTAAAATTTTGGAGAAAAAAACTGTCAAAATTTGTTATATAGATTTCAAAACCCTCATTTCCCCCTCACGCAAAACCCATCTCCGCCAATCTGCGTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021174
ATGGCTGGCACAGGATTCTCATTCGGCTTCTCCAGTACTGGCTCCGCCTCCTCCGCACCTTCCTTCGGCATTGCCTCCGGAACCACACCGGCCTCCGCCGCCTCACCTTCTTTTGGCGTCGCTTCCGGAGCCTCATCCACACCTTTATTTGGTTTTGGCTCCGCACCGACGTCCTCCTCCACACCGTCTTTTGGCTTTGCCTCCAACCCTAGCTCCGCGAATTCGTTTGGCTTTGGGTCGGGAACCGGCTCATCTCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806247.1
MAGTGFSFGFSSTGSASSAPSFGIASGTTPASAASPSFGVASGASSTPLFGFGSAPTSSSTPSFGFASNPSSANSFGFGSGTGSSPFGGSSPFGSSSSAAANIFGSTPGGAPTPGIFGSSSSGTGQTANAFGSAASNPAPTTPPPSSSPFGAQSAFGSPAPGSNLFGSGAPTPSLFGNSSSSAASASNTGSLFGSGASATPNPFGSTTAGSVASATPNLFGSTTAGSGASSTPSPFGLTTAASAPAFGSGLALNAGQFGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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