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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000061`

染色体: Chr04 坐标: 552316-553638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000061`
名称	SmilChr04G000061
描述	metalloendoproteinase 4-MMP-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	552316 - 553638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022786`
GeneID	`131022786`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022786`
原始查询	`SmilChr04G000061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metalloendoproteinase 4-MMP-like
产物	metalloendoproteinase 4-MMP-like
Arabidopsis	`AT2G45040` (AT2G45040) Matrixin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819111] identity=46.6; qcov=1; evalue=2.06e-112; confidence=high
Rice	`Os10g0557900` - identity=54; qcov=0.82; evalue=3.42e-109; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030198 (extracellular matrix organization); GO:0030574 (collagen catabolic process); GO:0031012 (extracellular matrix)
KEGG	-
Pfam	PF00413 (Peptidase_M10); PF01471 (PG_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022786

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057808292.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057808292.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808292.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:552470`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr4:552470`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr4:552471`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C2
`Chr4:552471`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C2
`Chr4:552472`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	106	A11,A14,A15,A16,A2,A20,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B107,B108,B109,B111,B115,B117,B119,B122,B124,B125,B132,B135,B137,B139,B140,B15,B18,B20,B25,B27,B30,B31,B34,B36,B4,B48,B50,B51,B54,B55,B56,B6,B60,B64,B67,B7,B71,B72,B76,B8,B82,B85,B88,B93,B94,B95,B96,B98,C12,C13,C15,C16,C19,C2,C21,C31,C32,C33,C39,C41,C44,C45,C48,C49,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C67,C68,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C80,C81,C84,C85,C9,D10,D2,D5,D6
`Chr4:552555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:552565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:552586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,D11
`Chr4:552642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:552853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B121,B45,C65
`Chr4:552877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr4:552929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808292.1

366 aa

183

366

PG_binding_1

Peptidase_M10

PF01471 PG_binding_1 70-127 aa PF00413 Peptidase_M10 158-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808292.1`	Pfam	`PF01471`	PG_binding_1	Domain	70	127	2.2e-09	38.1	Putative peptidoglycan binding domain
`XP_057808292.1`	Pfam	`PF00413`	Peptidase_M10	Domain	158	322	1e-48	166.0	Matrixin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952309.1
AAACTTCATTTCAAAGTCAAGATGAAGCCAATAAATCTTACACAAGAATGTTCTCATGAATCCATGCAAAAACCAATAATAATTTGAAAACTTATGCACCCATTTCTTTATATCAAAGCTTGCAAATACCTCCCTCGATCTCCATATGTTACATGACAAAAAAAAAATGTTATTATCATTTTTTTCTTGTTTTTTCCTTATCACTTTGGTCACTCTACAATCGAAAATCCATGCTAGAACACCAGCAATCGTCACCGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022786
ATGTTACATGACAAAAAAAAAATGTTATTATCATTTTTTTCTTGTTTTTTCCTTATCACTTTGGTCACTCTACAATCGAAAATCCATGCTAGAACACCAGCAATCGTCACCGTTAACCCCAAAAACACTTCCTCCGCGGGCGAAATCCGCAGCCACAGATGGCACGAATTCGAGAAGTTACGCGACGCGGCCAAGGGCAGCTCCGTCGACGGCATCTCGGAGCTGAAGAGATATTTCCATAGATTTGGATATTTAGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808292.1
MLHDKKKMLLSFFSCFFLITLVTLQSKIHARTPAIVTVNPKNTSSAGEIRSHRWHEFEKLRDAAKGSSVDGISELKRYFHRFGYLEAEDMRNSSTDLFDSNLEMAITKYQEKLGLSITGELDSATVSELMSPRCGVPDVAGKLHGAESYAYFAGRPRWGRKAPMRLTYAFSAANPIHASSLSEEEVRAAFRRSFARWAAVIPAAFAESADYESADIKIGFYSGEHGDGEAFDGVLGVLAHAFSPESGRFHLDAAETWAVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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