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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000062`

染色体: Chr04 坐标: 563072-564172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000062`
名称	SmilChr04G000062
描述	uncharacterized SmilChr04G000062
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	563072 - 564172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023662`
GeneID	`131023662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023662`
原始查询	`SmilChr04G000062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825223]; symbol=AT3G60520; hit=AT3G60520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825223]; symbol=AT3G60520; hit=AT3G60520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G60520` (AT3G60520) zinc ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825223] identity=55.1; qcov=1.06; evalue=6.17e-42; confidence=medium
Rice	`Os04g0551600` - identity=39.1; qcov=1.02; evalue=3.45e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25054 (PHD_pln)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809189.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809189.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809189.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809189.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:563416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:563450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B50,C45
`Chr4:563529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:563544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B88,C65
`Chr4:563921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:563979`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B127,B80,C71,C76
`Chr4:563979`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B127,B80,C71,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809189.1

130 aa

130

PHD_pln

PF25054 PHD_pln 9-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809189.1`	Pfam	`PF25054`	PHD_pln	Domain	9	52	2.2e-24	85.8	PHD-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953206.1
TTGTGTGCGTGTGCTGCACATATATATGAGAGATGCGCAAACCGACTTGAACACACACCACTTGTACCTTTTTCTTCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCTCTGCATCTTTTTCTGTGTGTGTTCCTCTTTAATTTCCTCTGTGGTGCCCAGATTTCCTCGATTCTCGTTCAAATCCATCGAAACGACAAAAAAAATGGTGGATCTCCAGACTGTGTGTTGTATGTGCGGCGATGTGGGGTTCCCGGACAAGCTCTTCCGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023662
ATGGTGGATCTCCAGACTGTGTGTTGTATGTGCGGCGATGTGGGGTTCCCGGACAAGCTCTTCCGCTGCTCCAAGTGCCGCAACCGCTTCCAGCACTCCTACTGCAGCAACTACTACAGCGAATACGCGGAGCCAATCGAGATTTGCGATTGGTGCCAATGCGAGGAAAGGAACCCGTCGTCGTCATCATCGTCGAGGCATGGGAATTCCACGCCAACGGCAGCTAGGAATAACAAGCATGCAAATGAAGCGAGGTCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809189.1
MVDLQTVCCMCGDVGFPDKLFRCSKCRNRFQHSYCSNYYSEYAEPIEICDWCQCEERNPSSSSSSRHGNSTPTAARNNKHANEARSAYSGDKIKQQRSEEGGSAAEKAAGKTSSPRPSPRRYKLLKDVMC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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