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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000064`

染色体: Chr04 坐标: 576471-586022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000064`
名称	SmilChr04G000064
描述	T-complex protein 1 subunit alpha
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	576471 - 586022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021991`
GeneID	`131021991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021991`
原始查询	`SmilChr04G000064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit alpha
产物	T-complex protein 1 subunit alpha
Arabidopsis	`AT3G20050` (TCP-1) T-complex protein 1 alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821544] identity=89; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0551800` - identity=89.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807308.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807308.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057807309.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057807309.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:578870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:579065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:579338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B50,C45,C59
`Chr4:579927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr4:580748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,D11
`Chr4:581208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:581661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B57,C35
`Chr4:584460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:584474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:584504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:584505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807308.1

546 aa

273

546

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 31-535 aa

XP_057807309.1

500 aa

250

500

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 1-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807308.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	31	535	2.8e-159	531.6	TCP-1/cpn60 chaperonin family
`XP_057807309.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	1	489	8.2e-150	500.4	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951325.1
GTATTATTTCAAAAATATTCCCTGAAACCCTCCCAAACGAACTGAGGTTTCTCCACATTTGGAGTGTTGAACTCGAACTCTCCAGAGAGGAGCTCGAGCAGCTCAGCCCTACTCTCGCTAATTCAACTATCTCTCCTCTCATCCGATCCGATCTAGGGTTTGCTCATTGTTTATGTTAATTATTTTTCATGGCTATTTCGTCATCGACTCCTGATATTTCCGGTGACCGGCAATCTGGCCAGGATGTTCGCACCCAAAAT...

XM_057951326.1
GCAGGTTTCCATCACCTTGTCTGTCCAACTAGCTGTCTCATGAGGCATGACCCGTGTTTGAAAACCATGCTACCTAACTTCTCTAAGTGATTGTGATCAATATCCTGTAAAGCTGCTTAAAGTTTATGTTTCAGCTGCTCCCCAGATTAACAGTAGATTAAGAGGATACATCATATATGTATATGGTAATCAACATAATTTTTTGGGATGCAGAAGGTGAAACTCTTTGTAGATATTTTTCTCAATACCTAGGTACTTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021991
ATGGCTATTTCGTCATCGACTCCTGATATTTCCGGTGACCGGCAATCTGGCCAGGATGTTCGCACCCAAAATGTTATGGCGTGCCAAGCAATTGCGAATATTGTCAAGTCATCGCTTGGTCCTGTTGGCCTCGACAAGATGCTTGTAGATGATATCGGTGACGTAACGATCACTAATGATGGTGCCACAATCCTAAAGATGCTTGAAGTTGAGCATCCTGCTGCCAAGGTGCTTGTTGAGTTGGCAGAATTACAAGACAG...

LOC131021991
ATGCTTGTAGATGATATCGGTGACGTAACGATCACTAATGATGGTGCCACAATCCTAAAGATGCTTGAAGTTGAGCATCCTGCTGCCAAGGTGCTTGTTGAGTTGGCAGAATTACAAGACAGAGAAGTTGGAGATGGGACAACGTCGGTGGTCATCATAGCTTCAGAATTGCTTAAGAAAGCCAATGATTTAGTGAGAAATAAGATTCATCCAACATCAATAATTAGTGGTTTCAGGCTGGCTATGAGGGAAGCATGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807308.1
MAISSSTPDISGDRQSGQDVRTQNVMACQAIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKMLEVEHPAAKVLVELAELQDREVGDGTTSVVIIASELLKKANDLVRNKIHPTSIISGFRLAMREACKYVDDKLAVKVEKLGKDSLVNCAKTSMSSKLIGGDSDFFASLVVDAVQLVKMTNARGEVRYPIKGINILKAHGKSARDSYLLKGYALNTGRAAQGMPLRVAPAKIACLDLNLQKTKMQMGVQVLVTDP...

XP_057807309.1
MLVDDIGDVTITNDGATILKMLEVEHPAAKVLVELAELQDREVGDGTTSVVIIASELLKKANDLVRNKIHPTSIISGFRLAMREACKYVDDKLAVKVEKLGKDSLVNCAKTSMSSKLIGGDSDFFASLVVDAVQLVKMTNARGEVRYPIKGINILKAHGKSARDSYLLKGYALNTGRAAQGMPLRVAPAKIACLDLNLQKTKMQMGVQVLVTDPRELERIRQREADMTKERIEKLLKAGANVVLTTKGIDDMALKYFVEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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