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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000066`

染色体: Chr04 坐标: 595454-599264 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000066`
名称	SmilChr04G000066
描述	protein root UVB sensitive 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	595454 - 599264 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021994`
GeneID	`131021994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021994`
原始查询	`SmilChr04G000066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein root UVB sensitive 3-like
产物	protein root UVB sensitive 3-like
Arabidopsis	`AT1G13770` (RUS3) root UVB sensitive protein (Protein of unknown function, DUF647) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837937] identity=85.9; qcov=0.934; evalue=2.67e-38; confidence=medium
Rice	`Os04g0290800` (OsRUS1) - identity=42.6; qcov=0.895; evalue=1.81e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04884 (UVB_sens_prot)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057807318.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057807319.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057807318.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057807319.1`
5	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057807319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:595701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr4:595703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B91,C55,C57,D1
`Chr4:595970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B27,C32
`Chr4:595999`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B26,B32,C49,D4
`Chr4:595999`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B26,B32,C49,D4
`Chr4:596137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:596149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:596315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C86
`Chr4:596317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:596322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B72,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807318.1

88 aa

UVB_sens_prot

PF04884 UVB_sens_prot 1-67 aa

XP_057807319.1

76 aa

UVB_sens_prot

PF04884 UVB_sens_prot 1-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807318.1`	Pfam	`PF04884`	UVB_sens_prot	Domain	1	67	4.5e-22	79.6	Vitamin B6 photo-protection and homoeostasis domain
`XP_057807319.1`	Pfam	`PF04884`	UVB_sens_prot	Domain	1	70	2.9e-23	83.5	Vitamin B6 photo-protection and homoeostasis domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951336.1
CACCAAATTTCCCCAAATCGAACCTAGACTCTTTCTCTCTTCAGTCTTCACCATCGTCCTGCCCTGCCACCGCCGTCGCGACACGCCGCCACGACCACCGCCGCCTGGCACTCGCTGCCCAGCCGATTCCTGAGACCCGCCTCCTCTACCTCTCGTCGTGCTAACGGCCAGCAACTCTCAGTCTCATCTCTCTACCTCTCTTACCCTCGTTGTCGGCCTCTCTGCCGTCACTCCTGCCTCCTCCGATCTCCCGTGGTTAC...

XM_057951335.1
CCACCAAATTTCCCCAAATCGAACCTAGACTCTTTCTCTCTTCAGTCTTCACCATCGTCCTGCCCTGCCACCGCCGTCGCGACACGCCGCCACGACCACCGCCGCCTGGCACTCGCTGCCCAGCCGATTCCTGAGACCCGCCTCCTCTACCTCTCGTCGTGCTAACGGCCAGCAACTCTCAGTCTCATCTCTCTACCTCTCTTACCCTCGTTGTCGGCCTCTCTGCCGTCACTCCTGCCTCCTCCGATCTCCCGTGGTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021994
ATGCTTTCCACCCATGCTCTTCTAAGTGCTATTGGGGTTGGTGAGAAATCGGCCACAGTTATTGGGGCCACATTTCAGTGGTTTCTAAGAGATTTAACTGGAATGCTTGGAGGTGTTTTGTTTACATTTTACCAGGGGGCAGACCTGGATAGCAATGCCAAAATGTGGCGTCTTGTTGCAGATCTCATGAATGACCTCGGAGAACCAGTAAAGTACATGGGCTGTGGGGACTGCGAGAATCTCAGTAAAGTACATGGGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807318.1
MLSTHALLSAIGVGEKSATVIGATFQWFLRDLTGMLGGVLFTFYQGADLDSNAKMWRLVADLMNDLGEPVKYMGCGDCENLSKVHGLW

XP_057807319.1
MLSTHALLSAIGVGEKSATVIGATFQWFLRDLTGMLGGVLFTFYQGADLDSNAKMWRLVADLMNDLAFIPDKEEEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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