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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000074`

染色体: Chr04 坐标: 691872-693812 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000074`
名称	SmilChr04G000074
描述	putative expansin-B2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	691872 - 693812 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022001`
GeneID	`131022001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022001`
原始查询	`SmilChr04G000074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative expansin-B2
产物	putative expansin-B2
Arabidopsis	`AT1G65680` (EXPB2) expansin B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842879] identity=56.6; qcov=0.94; evalue=7.51e-97; confidence=high
Rice	`Os04g0552000` (EXPB15) - identity=55; qcov=1.01; evalue=6.07e-95; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0019953 (sexual reproduction)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807327.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057807327.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807327.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807327.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807327.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:692023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:692065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr4:692077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr4:693315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:693333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:693377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:693423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807327.1

267 aa

134

267

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 78-155 aa PF01357 Expansin_C 168-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807327.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	78	155	4.2e-15	56.5	Lytic transglycolase
`XP_057807327.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	168	252	2.9e-19	69.7	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951344.1
ACAAAAATCACAAAAATATATTTCAATTAATCCCCTTGCATGCTCATGGCTTCTCTGTTCACTCACTTTGCTTTCTTCACTCTCATAGCAAACTTGTGCTATGGTTTCCACCCTAGACTTCTAAACGTATCCAAACTTCAGAATTCTGGATCGGACTGGTCTCCAGCCCGAGCCAGTTGGTACGGAAACCCTTCCGGTGCAGGCAGTGACGGGGGTGCATGTGGATATCAAAATGCTGTTGAAGAAGCACCTTATTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022001
ATGCTCATGGCTTCTCTGTTCACTCACTTTGCTTTCTTCACTCTCATAGCAAACTTGTGCTATGGTTTCCACCCTAGACTTCTAAACGTATCCAAACTTCAGAATTCTGGATCGGACTGGTCTCCAGCCCGAGCCAGTTGGTACGGAAACCCTTCCGGTGCAGGCAGTGACGGGGGTGCATGTGGATATCAAAATGCTGTTGAAGAAGCACCTTATTCTTCTCGAATAACAGCTGCTGCTTCTTCTCTCTACAAATCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807327.1
MLMASLFTHFAFFTLIANLCYGFHPRLLNVSKLQNSGSDWSPARASWYGNPSGAGSDGGACGYQNAVEEAPYSSRITAAASSLYKSGEACGTCYQVKCTTTAACSGKAVTVVITDECPGCDSQSILFDLSGTSFGTMARPGEADQLRNVGIEQIQYKRVECNFPGVTVAFRVDPGSNPNYFAAAIEYEDGDGITGVELRRAAESGGAWIKMQPSWGAVWKADLPNNYPPPFSFRLTGGGDSGKTIVANNVIPANYSPGKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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